Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2L5

RASSF4, Ras association domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 321 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASSF4Q9H2L5 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RASSF4Q9H2L5 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
RASSF4Q9H2L5 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
RASSF4Q9H2L5 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RASSF4Q9H2L5 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
RASSF4Q9H2L5 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RASSF4Q9H2L5 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RASSF4Q9H2L5 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RASSF4Q9H2L5 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
RASSF4Q9H2L5 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RASSF4Q9H2L5 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RASSF4Q9H2L5 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.27■■□□□ 1
RASSF4Q9H2L5 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RASSF4Q9H2L5 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RASSF4Q9H2L5 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
RASSF4Q9H2L5 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
RASSF4Q9H2L5 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
RASSF4Q9H2L5 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
RASSF4Q9H2L5 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
RASSF4Q9H2L5 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
RASSF4Q9H2L5 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
RASSF4Q9H2L5 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
RASSF4Q9H2L5 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC21.27■■□□□ 1
RASSF4Q9H2L5 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RASSF4Q9H2L5 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
RASSF4Q9H2L5 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
RASSF4Q9H2L5 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
RASSF4Q9H2L5 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
RASSF4Q9H2L5 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RASSF4Q9H2L5 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RASSF4Q9H2L5 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RASSF4Q9H2L5 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RASSF4Q9H2L5 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RASSF4Q9H2L5 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RASSF4Q9H2L5 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RASSF4Q9H2L5 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RASSF4Q9H2L5 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RASSF4Q9H2L5 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RASSF4Q9H2L5 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RASSF4Q9H2L5 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RASSF4Q9H2L5 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RASSF4Q9H2L5 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RASSF4Q9H2L5 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RASSF4Q9H2L5 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RASSF4Q9H2L5 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RASSF4Q9H2L5 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RASSF4Q9H2L5 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RASSF4Q9H2L5 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RASSF4Q9H2L5 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RASSF4Q9H2L5 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RASSF4Q9H2L5 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
RASSF4Q9H2L5 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
RASSF4Q9H2L5 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RASSF4Q9H2L5 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RASSF4Q9H2L5 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RASSF4Q9H2L5 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RASSF4Q9H2L5 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RASSF4Q9H2L5 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RASSF4Q9H2L5 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RASSF4Q9H2L5 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RASSF4Q9H2L5 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RASSF4Q9H2L5 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RASSF4Q9H2L5 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RASSF4Q9H2L5 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RASSF4Q9H2L5 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RASSF4Q9H2L5 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RASSF4Q9H2L5 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
RASSF4Q9H2L5 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RASSF4Q9H2L5 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RASSF4Q9H2L5 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
RASSF4Q9H2L5 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RASSF4Q9H2L5 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RASSF4Q9H2L5 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RASSF4Q9H2L5 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RASSF4Q9H2L5 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RASSF4Q9H2L5 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RASSF4Q9H2L5 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RASSF4Q9H2L5 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RASSF4Q9H2L5 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RASSF4Q9H2L5 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RASSF4Q9H2L5 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RASSF4Q9H2L5 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RASSF4Q9H2L5 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RASSF4Q9H2L5 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RASSF4Q9H2L5 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RASSF4Q9H2L5 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RASSF4Q9H2L5 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RASSF4Q9H2L5 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RASSF4Q9H2L5 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RASSF4Q9H2L5 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RASSF4Q9H2L5 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RASSF4Q9H2L5 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RASSF4Q9H2L5 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RASSF4Q9H2L5 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RASSF4Q9H2L5 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RASSF4Q9H2L5 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RASSF4Q9H2L5 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RASSF4Q9H2L5 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RASSF4Q9H2L5 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RASSF4Q9H2L5 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms