Protein–RNA interactions for Protein: Q9H190

SDCBP2, Syntenin-2, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDCBP2Q9H190 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SDCBP2Q9H190 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SDCBP2Q9H190 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SDCBP2Q9H190 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SDCBP2Q9H190 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SDCBP2Q9H190 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SDCBP2Q9H190 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SDCBP2Q9H190 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SDCBP2Q9H190 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SDCBP2Q9H190 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SDCBP2Q9H190 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SDCBP2Q9H190 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SDCBP2Q9H190 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SDCBP2Q9H190 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SDCBP2Q9H190 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SDCBP2Q9H190 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SDCBP2Q9H190 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SDCBP2Q9H190 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SDCBP2Q9H190 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SDCBP2Q9H190 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SDCBP2Q9H190 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SDCBP2Q9H190 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SDCBP2Q9H190 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SDCBP2Q9H190 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SDCBP2Q9H190 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SDCBP2Q9H190 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SDCBP2Q9H190 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SDCBP2Q9H190 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SDCBP2Q9H190 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SDCBP2Q9H190 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SDCBP2Q9H190 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SDCBP2Q9H190 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SDCBP2Q9H190 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SDCBP2Q9H190 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SDCBP2Q9H190 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SDCBP2Q9H190 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SDCBP2Q9H190 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SDCBP2Q9H190 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SDCBP2Q9H190 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SDCBP2Q9H190 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SDCBP2Q9H190 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SDCBP2Q9H190 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SDCBP2Q9H190 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SDCBP2Q9H190 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SDCBP2Q9H190 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SDCBP2Q9H190 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SDCBP2Q9H190 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SDCBP2Q9H190 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SDCBP2Q9H190 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SDCBP2Q9H190 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SDCBP2Q9H190 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SDCBP2Q9H190 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SDCBP2Q9H190 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SDCBP2Q9H190 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SDCBP2Q9H190 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SDCBP2Q9H190 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SDCBP2Q9H190 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SDCBP2Q9H190 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SDCBP2Q9H190 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SDCBP2Q9H190 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SDCBP2Q9H190 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SDCBP2Q9H190 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SDCBP2Q9H190 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SDCBP2Q9H190 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SDCBP2Q9H190 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SDCBP2Q9H190 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SDCBP2Q9H190 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SDCBP2Q9H190 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SDCBP2Q9H190 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SDCBP2Q9H190 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SDCBP2Q9H190 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SDCBP2Q9H190 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SDCBP2Q9H190 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SDCBP2Q9H190 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SDCBP2Q9H190 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SDCBP2Q9H190 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SDCBP2Q9H190 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SDCBP2Q9H190 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SDCBP2Q9H190 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SDCBP2Q9H190 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SDCBP2Q9H190 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SDCBP2Q9H190 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SDCBP2Q9H190 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SDCBP2Q9H190 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SDCBP2Q9H190 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SDCBP2Q9H190 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SDCBP2Q9H190 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SDCBP2Q9H190 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
SDCBP2Q9H190 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SDCBP2Q9H190 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SDCBP2Q9H190 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SDCBP2Q9H190 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SDCBP2Q9H190 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SDCBP2Q9H190 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SDCBP2Q9H190 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SDCBP2Q9H190 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SDCBP2Q9H190 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SDCBP2Q9H190 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SDCBP2Q9H190 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SDCBP2Q9H190 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms