Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0W8

SMG9, Protein SMG9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 520 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMG9Q9H0W8 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SMG9Q9H0W8 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SMG9Q9H0W8 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SMG9Q9H0W8 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SMG9Q9H0W8 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SMG9Q9H0W8 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SMG9Q9H0W8 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SMG9Q9H0W8 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SMG9Q9H0W8 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SMG9Q9H0W8 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SMG9Q9H0W8 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SMG9Q9H0W8 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SMG9Q9H0W8 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SMG9Q9H0W8 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SMG9Q9H0W8 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SMG9Q9H0W8 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SMG9Q9H0W8 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SMG9Q9H0W8 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SMG9Q9H0W8 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SMG9Q9H0W8 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SMG9Q9H0W8 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SMG9Q9H0W8 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMG9Q9H0W8 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMG9Q9H0W8 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMG9Q9H0W8 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMG9Q9H0W8 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMG9Q9H0W8 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMG9Q9H0W8 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMG9Q9H0W8 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMG9Q9H0W8 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMG9Q9H0W8 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMG9Q9H0W8 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SMG9Q9H0W8 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMG9Q9H0W8 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMG9Q9H0W8 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMG9Q9H0W8 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMG9Q9H0W8 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMG9Q9H0W8 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMG9Q9H0W8 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMG9Q9H0W8 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SMG9Q9H0W8 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMG9Q9H0W8 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMG9Q9H0W8 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SMG9Q9H0W8 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SMG9Q9H0W8 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SMG9Q9H0W8 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SMG9Q9H0W8 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SMG9Q9H0W8 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SMG9Q9H0W8 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SMG9Q9H0W8 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SMG9Q9H0W8 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SMG9Q9H0W8 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SMG9Q9H0W8 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SMG9Q9H0W8 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMG9Q9H0W8 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMG9Q9H0W8 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMG9Q9H0W8 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMG9Q9H0W8 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMG9Q9H0W8 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMG9Q9H0W8 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMG9Q9H0W8 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMG9Q9H0W8 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMG9Q9H0W8 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMG9Q9H0W8 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMG9Q9H0W8 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMG9Q9H0W8 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SMG9Q9H0W8 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SMG9Q9H0W8 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SMG9Q9H0W8 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SMG9Q9H0W8 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SMG9Q9H0W8 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SMG9Q9H0W8 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SMG9Q9H0W8 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SMG9Q9H0W8 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SMG9Q9H0W8 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SMG9Q9H0W8 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SMG9Q9H0W8 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SMG9Q9H0W8 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SMG9Q9H0W8 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SMG9Q9H0W8 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SMG9Q9H0W8 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SMG9Q9H0W8 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SMG9Q9H0W8 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SMG9Q9H0W8 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMG9Q9H0W8 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMG9Q9H0W8 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMG9Q9H0W8 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMG9Q9H0W8 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMG9Q9H0W8 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMG9Q9H0W8 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMG9Q9H0W8 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMG9Q9H0W8 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SMG9Q9H0W8 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMG9Q9H0W8 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMG9Q9H0W8 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMG9Q9H0W8 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMG9Q9H0W8 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMG9Q9H0W8 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMG9Q9H0W8 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMG9Q9H0W8 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
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