Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0D2

ZNF541, Zinc finger protein 541, humanhuman

Predictions only

Length 1,346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF541Q9H0D2 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
ZNF541Q9H0D2 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
ZNF541Q9H0D2 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
ZNF541Q9H0D2 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
ZNF541Q9H0D2 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
ZNF541Q9H0D2 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
ZNF541Q9H0D2 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.73
ZNF541Q9H0D2 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ZNF541Q9H0D2 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ZNF541Q9H0D2 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ZNF541Q9H0D2 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ZNF541Q9H0D2 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ZNF541Q9H0D2 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ZNF541Q9H0D2 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ZNF541Q9H0D2 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ZNF541Q9H0D2 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ZNF541Q9H0D2 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ZNF541Q9H0D2 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ZNF541Q9H0D2 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ZNF541Q9H0D2 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ZNF541Q9H0D2 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ZNF541Q9H0D2 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ZNF541Q9H0D2 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ZNF541Q9H0D2 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ZNF541Q9H0D2 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ZNF541Q9H0D2 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ZNF541Q9H0D2 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ZNF541Q9H0D2 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ZNF541Q9H0D2 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ZNF541Q9H0D2 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ZNF541Q9H0D2 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ZNF541Q9H0D2 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ZNF541Q9H0D2 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ZNF541Q9H0D2 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
ZNF541Q9H0D2 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ZNF541Q9H0D2 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ZNF541Q9H0D2 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ZNF541Q9H0D2 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ZNF541Q9H0D2 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ZNF541Q9H0D2 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ZNF541Q9H0D2 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ZNF541Q9H0D2 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ZNF541Q9H0D2 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ZNF541Q9H0D2 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ZNF541Q9H0D2 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ZNF541Q9H0D2 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ZNF541Q9H0D2 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ZNF541Q9H0D2 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ZNF541Q9H0D2 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ZNF541Q9H0D2 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ZNF541Q9H0D2 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ZNF541Q9H0D2 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
ZNF541Q9H0D2 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ZNF541Q9H0D2 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ZNF541Q9H0D2 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ZNF541Q9H0D2 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ZNF541Q9H0D2 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ZNF541Q9H0D2 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ZNF541Q9H0D2 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ZNF541Q9H0D2 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ZNF541Q9H0D2 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ZNF541Q9H0D2 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ZNF541Q9H0D2 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ZNF541Q9H0D2 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ZNF541Q9H0D2 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ZNF541Q9H0D2 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ZNF541Q9H0D2 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ZNF541Q9H0D2 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ZNF541Q9H0D2 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
ZNF541Q9H0D2 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ZNF541Q9H0D2 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ZNF541Q9H0D2 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
ZNF541Q9H0D2 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ZNF541Q9H0D2 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
ZNF541Q9H0D2 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.72
ZNF541Q9H0D2 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
ZNF541Q9H0D2 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
ZNF541Q9H0D2 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
ZNF541Q9H0D2 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC25.83■■□□□ 1.72
ZNF541Q9H0D2 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ZNF541Q9H0D2 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ZNF541Q9H0D2 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ZNF541Q9H0D2 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ZNF541Q9H0D2 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ZNF541Q9H0D2 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ZNF541Q9H0D2 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ZNF541Q9H0D2 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ZNF541Q9H0D2 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ZNF541Q9H0D2 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ZNF541Q9H0D2 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ZNF541Q9H0D2 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ZNF541Q9H0D2 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ZNF541Q9H0D2 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ZNF541Q9H0D2 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ZNF541Q9H0D2 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ZNF541Q9H0D2 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ZNF541Q9H0D2 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ZNF541Q9H0D2 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ZNF541Q9H0D2 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
ZNF541Q9H0D2 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms