Protein–RNA interactions for Protein: Q9H000

MKRN2, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN2Q9H000 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MKRN2Q9H000 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
MKRN2Q9H000 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
MKRN2Q9H000 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
MKRN2Q9H000 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
MKRN2Q9H000 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MKRN2Q9H000 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MKRN2Q9H000 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
MKRN2Q9H000 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MKRN2Q9H000 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MKRN2Q9H000 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MKRN2Q9H000 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MKRN2Q9H000 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MKRN2Q9H000 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MKRN2Q9H000 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MKRN2Q9H000 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MKRN2Q9H000 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MKRN2Q9H000 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MKRN2Q9H000 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MKRN2Q9H000 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MKRN2Q9H000 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MKRN2Q9H000 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
MKRN2Q9H000 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MKRN2Q9H000 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MKRN2Q9H000 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MKRN2Q9H000 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MKRN2Q9H000 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MKRN2Q9H000 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MKRN2Q9H000 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MKRN2Q9H000 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MKRN2Q9H000 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MKRN2Q9H000 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MKRN2Q9H000 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MKRN2Q9H000 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MKRN2Q9H000 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MKRN2Q9H000 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MKRN2Q9H000 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MKRN2Q9H000 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MKRN2Q9H000 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MKRN2Q9H000 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
MKRN2Q9H000 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
MKRN2Q9H000 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MKRN2Q9H000 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MKRN2Q9H000 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MKRN2Q9H000 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MKRN2Q9H000 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MKRN2Q9H000 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MKRN2Q9H000 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MKRN2Q9H000 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MKRN2Q9H000 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MKRN2Q9H000 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MKRN2Q9H000 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MKRN2Q9H000 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MKRN2Q9H000 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MKRN2Q9H000 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
MKRN2Q9H000 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MKRN2Q9H000 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MKRN2Q9H000 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MKRN2Q9H000 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MKRN2Q9H000 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MKRN2Q9H000 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MKRN2Q9H000 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MKRN2Q9H000 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MKRN2Q9H000 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MKRN2Q9H000 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MKRN2Q9H000 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MKRN2Q9H000 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MKRN2Q9H000 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MKRN2Q9H000 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MKRN2Q9H000 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MKRN2Q9H000 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MKRN2Q9H000 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MKRN2Q9H000 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MKRN2Q9H000 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MKRN2Q9H000 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MKRN2Q9H000 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MKRN2Q9H000 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MKRN2Q9H000 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MKRN2Q9H000 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MKRN2Q9H000 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
MKRN2Q9H000 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MKRN2Q9H000 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MKRN2Q9H000 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MKRN2Q9H000 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MKRN2Q9H000 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MKRN2Q9H000 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MKRN2Q9H000 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MKRN2Q9H000 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MKRN2Q9H000 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MKRN2Q9H000 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MKRN2Q9H000 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MKRN2Q9H000 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
MKRN2Q9H000 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MKRN2Q9H000 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MKRN2Q9H000 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MKRN2Q9H000 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MKRN2Q9H000 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MKRN2Q9H000 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MKRN2Q9H000 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MKRN2Q9H000 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms