Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZU1

MCOLN1, Mucolipin-1, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCOLN1Q9GZU1 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
MCOLN1Q9GZU1 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
MCOLN1Q9GZU1 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MCOLN1Q9GZU1 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MCOLN1Q9GZU1 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MCOLN1Q9GZU1 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MCOLN1Q9GZU1 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MCOLN1Q9GZU1 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MCOLN1Q9GZU1 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MCOLN1Q9GZU1 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
MCOLN1Q9GZU1 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
MCOLN1Q9GZU1 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MCOLN1Q9GZU1 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MCOLN1Q9GZU1 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MCOLN1Q9GZU1 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MCOLN1Q9GZU1 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MCOLN1Q9GZU1 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MCOLN1Q9GZU1 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MCOLN1Q9GZU1 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MCOLN1Q9GZU1 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MCOLN1Q9GZU1 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MCOLN1Q9GZU1 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MCOLN1Q9GZU1 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MCOLN1Q9GZU1 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MCOLN1Q9GZU1 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MCOLN1Q9GZU1 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MCOLN1Q9GZU1 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
MCOLN1Q9GZU1 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MCOLN1Q9GZU1 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MCOLN1Q9GZU1 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MCOLN1Q9GZU1 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MCOLN1Q9GZU1 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MCOLN1Q9GZU1 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MCOLN1Q9GZU1 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MCOLN1Q9GZU1 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MCOLN1Q9GZU1 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MCOLN1Q9GZU1 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MCOLN1Q9GZU1 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MCOLN1Q9GZU1 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MCOLN1Q9GZU1 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MCOLN1Q9GZU1 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MCOLN1Q9GZU1 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MCOLN1Q9GZU1 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MCOLN1Q9GZU1 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MCOLN1Q9GZU1 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MCOLN1Q9GZU1 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MCOLN1Q9GZU1 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MCOLN1Q9GZU1 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MCOLN1Q9GZU1 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MCOLN1Q9GZU1 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MCOLN1Q9GZU1 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
MCOLN1Q9GZU1 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MCOLN1Q9GZU1 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MCOLN1Q9GZU1 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MCOLN1Q9GZU1 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MCOLN1Q9GZU1 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MCOLN1Q9GZU1 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
MCOLN1Q9GZU1 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MCOLN1Q9GZU1 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
MCOLN1Q9GZU1 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MCOLN1Q9GZU1 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MCOLN1Q9GZU1 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MCOLN1Q9GZU1 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MCOLN1Q9GZU1 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MCOLN1Q9GZU1 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MCOLN1Q9GZU1 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MCOLN1Q9GZU1 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MCOLN1Q9GZU1 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MCOLN1Q9GZU1 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MCOLN1Q9GZU1 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MCOLN1Q9GZU1 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MCOLN1Q9GZU1 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MCOLN1Q9GZU1 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MCOLN1Q9GZU1 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MCOLN1Q9GZU1 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MCOLN1Q9GZU1 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MCOLN1Q9GZU1 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MCOLN1Q9GZU1 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MCOLN1Q9GZU1 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
MCOLN1Q9GZU1 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MCOLN1Q9GZU1 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MCOLN1Q9GZU1 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MCOLN1Q9GZU1 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MCOLN1Q9GZU1 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MCOLN1Q9GZU1 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MCOLN1Q9GZU1 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MCOLN1Q9GZU1 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MCOLN1Q9GZU1 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MCOLN1Q9GZU1 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MCOLN1Q9GZU1 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MCOLN1Q9GZU1 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MCOLN1Q9GZU1 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
MCOLN1Q9GZU1 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MCOLN1Q9GZU1 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
MCOLN1Q9GZU1 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MCOLN1Q9GZU1 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MCOLN1Q9GZU1 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MCOLN1Q9GZU1 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MCOLN1Q9GZU1 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MCOLN1Q9GZU1 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.2 ms