Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZP0

PDGFD, Platelet-derived growth factor D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFDQ9GZP0 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PDGFDQ9GZP0 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PDGFDQ9GZP0 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PDGFDQ9GZP0 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PDGFDQ9GZP0 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PDGFDQ9GZP0 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
PDGFDQ9GZP0 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PDGFDQ9GZP0 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PDGFDQ9GZP0 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PDGFDQ9GZP0 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PDGFDQ9GZP0 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PDGFDQ9GZP0 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PDGFDQ9GZP0 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PDGFDQ9GZP0 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PDGFDQ9GZP0 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PDGFDQ9GZP0 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PDGFDQ9GZP0 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PDGFDQ9GZP0 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PDGFDQ9GZP0 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PDGFDQ9GZP0 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PDGFDQ9GZP0 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PDGFDQ9GZP0 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PDGFDQ9GZP0 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PDGFDQ9GZP0 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PDGFDQ9GZP0 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PDGFDQ9GZP0 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PDGFDQ9GZP0 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PDGFDQ9GZP0 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
PDGFDQ9GZP0 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
PDGFDQ9GZP0 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PDGFDQ9GZP0 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PDGFDQ9GZP0 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PDGFDQ9GZP0 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PDGFDQ9GZP0 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
PDGFDQ9GZP0 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
PDGFDQ9GZP0 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
PDGFDQ9GZP0 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
PDGFDQ9GZP0 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
PDGFDQ9GZP0 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PDGFDQ9GZP0 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
PDGFDQ9GZP0 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
PDGFDQ9GZP0 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
PDGFDQ9GZP0 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
PDGFDQ9GZP0 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
PDGFDQ9GZP0 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.94
PDGFDQ9GZP0 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
PDGFDQ9GZP0 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PDGFDQ9GZP0 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PDGFDQ9GZP0 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PDGFDQ9GZP0 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PDGFDQ9GZP0 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PDGFDQ9GZP0 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PDGFDQ9GZP0 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PDGFDQ9GZP0 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PDGFDQ9GZP0 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PDGFDQ9GZP0 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PDGFDQ9GZP0 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PDGFDQ9GZP0 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PDGFDQ9GZP0 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PDGFDQ9GZP0 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PDGFDQ9GZP0 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PDGFDQ9GZP0 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PDGFDQ9GZP0 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PDGFDQ9GZP0 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PDGFDQ9GZP0 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PDGFDQ9GZP0 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PDGFDQ9GZP0 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PDGFDQ9GZP0 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PDGFDQ9GZP0 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PDGFDQ9GZP0 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PDGFDQ9GZP0 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
PDGFDQ9GZP0 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PDGFDQ9GZP0 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PDGFDQ9GZP0 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PDGFDQ9GZP0 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PDGFDQ9GZP0 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PDGFDQ9GZP0 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PDGFDQ9GZP0 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PDGFDQ9GZP0 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PDGFDQ9GZP0 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PDGFDQ9GZP0 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PDGFDQ9GZP0 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PDGFDQ9GZP0 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PDGFDQ9GZP0 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PDGFDQ9GZP0 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PDGFDQ9GZP0 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PDGFDQ9GZP0 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
PDGFDQ9GZP0 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PDGFDQ9GZP0 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PDGFDQ9GZP0 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PDGFDQ9GZP0 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PDGFDQ9GZP0 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PDGFDQ9GZP0 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PDGFDQ9GZP0 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PDGFDQ9GZP0 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PDGFDQ9GZP0 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PDGFDQ9GZP0 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PDGFDQ9GZP0 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PDGFDQ9GZP0 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.94
PDGFDQ9GZP0 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms