Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C6

CIPC, CLOCK-interacting pacemaker, humanhuman

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Length 399 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIPCQ9C0C6 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CIPCQ9C0C6 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CIPCQ9C0C6 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CIPCQ9C0C6 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CIPCQ9C0C6 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CIPCQ9C0C6 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
CIPCQ9C0C6 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CIPCQ9C0C6 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CIPCQ9C0C6 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CIPCQ9C0C6 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CIPCQ9C0C6 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CIPCQ9C0C6 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CIPCQ9C0C6 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CIPCQ9C0C6 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CIPCQ9C0C6 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CIPCQ9C0C6 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CIPCQ9C0C6 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
CIPCQ9C0C6 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CIPCQ9C0C6 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CIPCQ9C0C6 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CIPCQ9C0C6 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CIPCQ9C0C6 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CIPCQ9C0C6 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CIPCQ9C0C6 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CIPCQ9C0C6 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CIPCQ9C0C6 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CIPCQ9C0C6 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
CIPCQ9C0C6 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CIPCQ9C0C6 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
CIPCQ9C0C6 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CIPCQ9C0C6 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CIPCQ9C0C6 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CIPCQ9C0C6 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CIPCQ9C0C6 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
CIPCQ9C0C6 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CIPCQ9C0C6 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CIPCQ9C0C6 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CIPCQ9C0C6 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CIPCQ9C0C6 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CIPCQ9C0C6 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CIPCQ9C0C6 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CIPCQ9C0C6 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CIPCQ9C0C6 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CIPCQ9C0C6 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
CIPCQ9C0C6 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CIPCQ9C0C6 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CIPCQ9C0C6 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
CIPCQ9C0C6 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CIPCQ9C0C6 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CIPCQ9C0C6 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CIPCQ9C0C6 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CIPCQ9C0C6 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CIPCQ9C0C6 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CIPCQ9C0C6 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CIPCQ9C0C6 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CIPCQ9C0C6 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CIPCQ9C0C6 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CIPCQ9C0C6 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CIPCQ9C0C6 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CIPCQ9C0C6 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CIPCQ9C0C6 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CIPCQ9C0C6 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CIPCQ9C0C6 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CIPCQ9C0C6 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CIPCQ9C0C6 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CIPCQ9C0C6 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CIPCQ9C0C6 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CIPCQ9C0C6 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CIPCQ9C0C6 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CIPCQ9C0C6 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CIPCQ9C0C6 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CIPCQ9C0C6 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CIPCQ9C0C6 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
CIPCQ9C0C6 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CIPCQ9C0C6 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CIPCQ9C0C6 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
CIPCQ9C0C6 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CIPCQ9C0C6 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CIPCQ9C0C6 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CIPCQ9C0C6 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CIPCQ9C0C6 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CIPCQ9C0C6 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CIPCQ9C0C6 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CIPCQ9C0C6 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CIPCQ9C0C6 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CIPCQ9C0C6 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CIPCQ9C0C6 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CIPCQ9C0C6 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CIPCQ9C0C6 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CIPCQ9C0C6 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CIPCQ9C0C6 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CIPCQ9C0C6 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CIPCQ9C0C6 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CIPCQ9C0C6 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CIPCQ9C0C6 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CIPCQ9C0C6 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CIPCQ9C0C6 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CIPCQ9C0C6 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CIPCQ9C0C6 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CIPCQ9C0C6 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
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