Protein–RNA interactions for Protein: Q9C030

TRIM6, Tripartite motif-containing protein 6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 488 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM6Q9C030 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRIM6Q9C030 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRIM6Q9C030 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRIM6Q9C030 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRIM6Q9C030 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRIM6Q9C030 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRIM6Q9C030 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRIM6Q9C030 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRIM6Q9C030 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRIM6Q9C030 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
TRIM6Q9C030 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRIM6Q9C030 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRIM6Q9C030 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRIM6Q9C030 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRIM6Q9C030 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRIM6Q9C030 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRIM6Q9C030 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRIM6Q9C030 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
TRIM6Q9C030 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRIM6Q9C030 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRIM6Q9C030 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRIM6Q9C030 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
TRIM6Q9C030 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRIM6Q9C030 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRIM6Q9C030 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRIM6Q9C030 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRIM6Q9C030 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRIM6Q9C030 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRIM6Q9C030 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRIM6Q9C030 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRIM6Q9C030 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRIM6Q9C030 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRIM6Q9C030 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRIM6Q9C030 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
TRIM6Q9C030 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRIM6Q9C030 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRIM6Q9C030 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRIM6Q9C030 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRIM6Q9C030 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRIM6Q9C030 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
TRIM6Q9C030 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRIM6Q9C030 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRIM6Q9C030 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRIM6Q9C030 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRIM6Q9C030 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRIM6Q9C030 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRIM6Q9C030 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRIM6Q9C030 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRIM6Q9C030 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRIM6Q9C030 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRIM6Q9C030 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRIM6Q9C030 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRIM6Q9C030 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRIM6Q9C030 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRIM6Q9C030 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRIM6Q9C030 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRIM6Q9C030 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRIM6Q9C030 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRIM6Q9C030 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
TRIM6Q9C030 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.32
TRIM6Q9C030 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TRIM6Q9C030 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TRIM6Q9C030 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
TRIM6Q9C030 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
TRIM6Q9C030 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
TRIM6Q9C030 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRIM6Q9C030 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRIM6Q9C030 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRIM6Q9C030 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRIM6Q9C030 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRIM6Q9C030 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRIM6Q9C030 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRIM6Q9C030 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRIM6Q9C030 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRIM6Q9C030 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRIM6Q9C030 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRIM6Q9C030 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRIM6Q9C030 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRIM6Q9C030 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRIM6Q9C030 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRIM6Q9C030 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRIM6Q9C030 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRIM6Q9C030 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRIM6Q9C030 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRIM6Q9C030 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
TRIM6Q9C030 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRIM6Q9C030 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRIM6Q9C030 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRIM6Q9C030 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRIM6Q9C030 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRIM6Q9C030 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRIM6Q9C030 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRIM6Q9C030 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRIM6Q9C030 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRIM6Q9C030 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRIM6Q9C030 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRIM6Q9C030 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRIM6Q9C030 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRIM6Q9C030 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRIM6Q9C030 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.4 ms