Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYX4

IFIH1, Interferon-induced helicase C domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,025 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFIH1Q9BYX4 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
IFIH1Q9BYX4 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
IFIH1Q9BYX4 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
IFIH1Q9BYX4 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
IFIH1Q9BYX4 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
IFIH1Q9BYX4 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
IFIH1Q9BYX4 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
IFIH1Q9BYX4 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
IFIH1Q9BYX4 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
IFIH1Q9BYX4 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
IFIH1Q9BYX4 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
IFIH1Q9BYX4 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
IFIH1Q9BYX4 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
IFIH1Q9BYX4 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
IFIH1Q9BYX4 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
IFIH1Q9BYX4 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
IFIH1Q9BYX4 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
IFIH1Q9BYX4 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
IFIH1Q9BYX4 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
IFIH1Q9BYX4 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
IFIH1Q9BYX4 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
IFIH1Q9BYX4 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
IFIH1Q9BYX4 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
IFIH1Q9BYX4 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
IFIH1Q9BYX4 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
IFIH1Q9BYX4 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
IFIH1Q9BYX4 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
IFIH1Q9BYX4 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC23.92■■□□□ 1.42
IFIH1Q9BYX4 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
IFIH1Q9BYX4 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
IFIH1Q9BYX4 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
IFIH1Q9BYX4 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
IFIH1Q9BYX4 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
IFIH1Q9BYX4 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
IFIH1Q9BYX4 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
IFIH1Q9BYX4 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
IFIH1Q9BYX4 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
IFIH1Q9BYX4 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC23.91■■□□□ 1.42
IFIH1Q9BYX4 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
IFIH1Q9BYX4 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
IFIH1Q9BYX4 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
IFIH1Q9BYX4 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
IFIH1Q9BYX4 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
IFIH1Q9BYX4 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
IFIH1Q9BYX4 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
IFIH1Q9BYX4 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
IFIH1Q9BYX4 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
IFIH1Q9BYX4 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
IFIH1Q9BYX4 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
IFIH1Q9BYX4 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
IFIH1Q9BYX4 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
IFIH1Q9BYX4 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
IFIH1Q9BYX4 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
IFIH1Q9BYX4 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
IFIH1Q9BYX4 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
IFIH1Q9BYX4 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
IFIH1Q9BYX4 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
IFIH1Q9BYX4 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
IFIH1Q9BYX4 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
IFIH1Q9BYX4 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
IFIH1Q9BYX4 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
IFIH1Q9BYX4 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
IFIH1Q9BYX4 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
IFIH1Q9BYX4 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
IFIH1Q9BYX4 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
IFIH1Q9BYX4 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
IFIH1Q9BYX4 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
IFIH1Q9BYX4 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
IFIH1Q9BYX4 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
IFIH1Q9BYX4 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
IFIH1Q9BYX4 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
IFIH1Q9BYX4 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
IFIH1Q9BYX4 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
IFIH1Q9BYX4 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
IFIH1Q9BYX4 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
IFIH1Q9BYX4 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
IFIH1Q9BYX4 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
IFIH1Q9BYX4 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
IFIH1Q9BYX4 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
IFIH1Q9BYX4 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
IFIH1Q9BYX4 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
IFIH1Q9BYX4 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
IFIH1Q9BYX4 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
IFIH1Q9BYX4 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
IFIH1Q9BYX4 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
IFIH1Q9BYX4 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
IFIH1Q9BYX4 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
IFIH1Q9BYX4 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
IFIH1Q9BYX4 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
IFIH1Q9BYX4 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
IFIH1Q9BYX4 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
IFIH1Q9BYX4 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
IFIH1Q9BYX4 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
IFIH1Q9BYX4 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
IFIH1Q9BYX4 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
IFIH1Q9BYX4 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
IFIH1Q9BYX4 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
IFIH1Q9BYX4 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
IFIH1Q9BYX4 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC23.86■■□□□ 1.41
IFIH1Q9BYX4 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms