Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXS0

COL25A1, Collagen alpha-1(XXV) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 654 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL25A1Q9BXS0 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
COL25A1Q9BXS0 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
COL25A1Q9BXS0 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
COL25A1Q9BXS0 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
COL25A1Q9BXS0 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
COL25A1Q9BXS0 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
COL25A1Q9BXS0 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
COL25A1Q9BXS0 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
COL25A1Q9BXS0 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
COL25A1Q9BXS0 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
COL25A1Q9BXS0 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
COL25A1Q9BXS0 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
COL25A1Q9BXS0 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
COL25A1Q9BXS0 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
COL25A1Q9BXS0 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
COL25A1Q9BXS0 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
COL25A1Q9BXS0 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
COL25A1Q9BXS0 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
COL25A1Q9BXS0 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
COL25A1Q9BXS0 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
COL25A1Q9BXS0 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
COL25A1Q9BXS0 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
COL25A1Q9BXS0 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
COL25A1Q9BXS0 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
COL25A1Q9BXS0 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
COL25A1Q9BXS0 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
COL25A1Q9BXS0 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
COL25A1Q9BXS0 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
COL25A1Q9BXS0 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
COL25A1Q9BXS0 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
COL25A1Q9BXS0 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
COL25A1Q9BXS0 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
COL25A1Q9BXS0 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
COL25A1Q9BXS0 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
COL25A1Q9BXS0 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
COL25A1Q9BXS0 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
COL25A1Q9BXS0 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
COL25A1Q9BXS0 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
COL25A1Q9BXS0 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
COL25A1Q9BXS0 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
COL25A1Q9BXS0 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
COL25A1Q9BXS0 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
COL25A1Q9BXS0 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
COL25A1Q9BXS0 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
COL25A1Q9BXS0 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
COL25A1Q9BXS0 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
COL25A1Q9BXS0 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
COL25A1Q9BXS0 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
COL25A1Q9BXS0 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
COL25A1Q9BXS0 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
COL25A1Q9BXS0 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
COL25A1Q9BXS0 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
COL25A1Q9BXS0 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
COL25A1Q9BXS0 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
COL25A1Q9BXS0 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
COL25A1Q9BXS0 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
COL25A1Q9BXS0 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
COL25A1Q9BXS0 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
COL25A1Q9BXS0 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
COL25A1Q9BXS0 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
COL25A1Q9BXS0 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
COL25A1Q9BXS0 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
COL25A1Q9BXS0 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
COL25A1Q9BXS0 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
COL25A1Q9BXS0 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
COL25A1Q9BXS0 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
COL25A1Q9BXS0 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
COL25A1Q9BXS0 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
COL25A1Q9BXS0 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
COL25A1Q9BXS0 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
COL25A1Q9BXS0 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
COL25A1Q9BXS0 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
COL25A1Q9BXS0 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
COL25A1Q9BXS0 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
COL25A1Q9BXS0 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
COL25A1Q9BXS0 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
COL25A1Q9BXS0 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
COL25A1Q9BXS0 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
COL25A1Q9BXS0 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
COL25A1Q9BXS0 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
COL25A1Q9BXS0 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
COL25A1Q9BXS0 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
COL25A1Q9BXS0 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
COL25A1Q9BXS0 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
COL25A1Q9BXS0 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
COL25A1Q9BXS0 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
COL25A1Q9BXS0 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
COL25A1Q9BXS0 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
COL25A1Q9BXS0 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
COL25A1Q9BXS0 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
COL25A1Q9BXS0 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
COL25A1Q9BXS0 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
COL25A1Q9BXS0 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
COL25A1Q9BXS0 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
COL25A1Q9BXS0 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
COL25A1Q9BXS0 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
COL25A1Q9BXS0 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
COL25A1Q9BXS0 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
COL25A1Q9BXS0 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
COL25A1Q9BXS0 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms