Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWE0

REPIN1, Replication initiator 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 567 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REPIN1Q9BWE0 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
REPIN1Q9BWE0 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
REPIN1Q9BWE0 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
REPIN1Q9BWE0 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
REPIN1Q9BWE0 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
REPIN1Q9BWE0 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
REPIN1Q9BWE0 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
REPIN1Q9BWE0 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
REPIN1Q9BWE0 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
REPIN1Q9BWE0 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
REPIN1Q9BWE0 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
REPIN1Q9BWE0 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
REPIN1Q9BWE0 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
REPIN1Q9BWE0 AC017007.3-201ENST00000479865 435 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
REPIN1Q9BWE0 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
REPIN1Q9BWE0 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
REPIN1Q9BWE0 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
REPIN1Q9BWE0 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
REPIN1Q9BWE0 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
REPIN1Q9BWE0 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
REPIN1Q9BWE0 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
REPIN1Q9BWE0 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
REPIN1Q9BWE0 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
REPIN1Q9BWE0 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
REPIN1Q9BWE0 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
REPIN1Q9BWE0 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
REPIN1Q9BWE0 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
REPIN1Q9BWE0 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
REPIN1Q9BWE0 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
REPIN1Q9BWE0 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
REPIN1Q9BWE0 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
REPIN1Q9BWE0 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
REPIN1Q9BWE0 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
REPIN1Q9BWE0 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
REPIN1Q9BWE0 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
REPIN1Q9BWE0 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
REPIN1Q9BWE0 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
REPIN1Q9BWE0 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
REPIN1Q9BWE0 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
REPIN1Q9BWE0 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
REPIN1Q9BWE0 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
REPIN1Q9BWE0 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
REPIN1Q9BWE0 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
REPIN1Q9BWE0 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
REPIN1Q9BWE0 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
REPIN1Q9BWE0 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
REPIN1Q9BWE0 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
REPIN1Q9BWE0 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
REPIN1Q9BWE0 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
REPIN1Q9BWE0 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
REPIN1Q9BWE0 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
REPIN1Q9BWE0 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
REPIN1Q9BWE0 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
REPIN1Q9BWE0 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
REPIN1Q9BWE0 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
REPIN1Q9BWE0 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
REPIN1Q9BWE0 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
REPIN1Q9BWE0 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
REPIN1Q9BWE0 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
REPIN1Q9BWE0 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
REPIN1Q9BWE0 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
REPIN1Q9BWE0 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
REPIN1Q9BWE0 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
REPIN1Q9BWE0 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
REPIN1Q9BWE0 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
REPIN1Q9BWE0 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
REPIN1Q9BWE0 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
REPIN1Q9BWE0 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
REPIN1Q9BWE0 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
REPIN1Q9BWE0 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
REPIN1Q9BWE0 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
REPIN1Q9BWE0 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
REPIN1Q9BWE0 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
REPIN1Q9BWE0 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
REPIN1Q9BWE0 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
REPIN1Q9BWE0 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
REPIN1Q9BWE0 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
REPIN1Q9BWE0 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
REPIN1Q9BWE0 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
REPIN1Q9BWE0 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
REPIN1Q9BWE0 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
REPIN1Q9BWE0 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
REPIN1Q9BWE0 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
REPIN1Q9BWE0 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
REPIN1Q9BWE0 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
REPIN1Q9BWE0 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
REPIN1Q9BWE0 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
REPIN1Q9BWE0 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
REPIN1Q9BWE0 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
REPIN1Q9BWE0 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
REPIN1Q9BWE0 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
REPIN1Q9BWE0 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
REPIN1Q9BWE0 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
REPIN1Q9BWE0 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
REPIN1Q9BWE0 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
REPIN1Q9BWE0 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
REPIN1Q9BWE0 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
REPIN1Q9BWE0 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
REPIN1Q9BWE0 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
REPIN1Q9BWE0 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms