Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVA1

TUBB2B, Tubulin beta-2B chain, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB2BQ9BVA1 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TUBB2BQ9BVA1 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TUBB2BQ9BVA1 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TUBB2BQ9BVA1 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
TUBB2BQ9BVA1 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
TUBB2BQ9BVA1 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TUBB2BQ9BVA1 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TUBB2BQ9BVA1 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TUBB2BQ9BVA1 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TUBB2BQ9BVA1 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TUBB2BQ9BVA1 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TUBB2BQ9BVA1 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TUBB2BQ9BVA1 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TUBB2BQ9BVA1 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TUBB2BQ9BVA1 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TUBB2BQ9BVA1 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TUBB2BQ9BVA1 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TUBB2BQ9BVA1 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TUBB2BQ9BVA1 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TUBB2BQ9BVA1 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TUBB2BQ9BVA1 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TUBB2BQ9BVA1 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TUBB2BQ9BVA1 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TUBB2BQ9BVA1 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TUBB2BQ9BVA1 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TUBB2BQ9BVA1 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TUBB2BQ9BVA1 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TUBB2BQ9BVA1 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TUBB2BQ9BVA1 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TUBB2BQ9BVA1 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TUBB2BQ9BVA1 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TUBB2BQ9BVA1 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TUBB2BQ9BVA1 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TUBB2BQ9BVA1 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TUBB2BQ9BVA1 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TUBB2BQ9BVA1 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TUBB2BQ9BVA1 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TUBB2BQ9BVA1 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TUBB2BQ9BVA1 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TUBB2BQ9BVA1 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TUBB2BQ9BVA1 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TUBB2BQ9BVA1 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TUBB2BQ9BVA1 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TUBB2BQ9BVA1 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TUBB2BQ9BVA1 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TUBB2BQ9BVA1 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TUBB2BQ9BVA1 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TUBB2BQ9BVA1 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TUBB2BQ9BVA1 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TUBB2BQ9BVA1 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TUBB2BQ9BVA1 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TUBB2BQ9BVA1 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TUBB2BQ9BVA1 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TUBB2BQ9BVA1 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TUBB2BQ9BVA1 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TUBB2BQ9BVA1 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TUBB2BQ9BVA1 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TUBB2BQ9BVA1 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
TUBB2BQ9BVA1 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TUBB2BQ9BVA1 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TUBB2BQ9BVA1 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
TUBB2BQ9BVA1 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TUBB2BQ9BVA1 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TUBB2BQ9BVA1 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TUBB2BQ9BVA1 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TUBB2BQ9BVA1 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TUBB2BQ9BVA1 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TUBB2BQ9BVA1 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TUBB2BQ9BVA1 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TUBB2BQ9BVA1 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TUBB2BQ9BVA1 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TUBB2BQ9BVA1 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TUBB2BQ9BVA1 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TUBB2BQ9BVA1 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TUBB2BQ9BVA1 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TUBB2BQ9BVA1 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
TUBB2BQ9BVA1 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TUBB2BQ9BVA1 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TUBB2BQ9BVA1 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TUBB2BQ9BVA1 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TUBB2BQ9BVA1 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
TUBB2BQ9BVA1 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
TUBB2BQ9BVA1 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TUBB2BQ9BVA1 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TUBB2BQ9BVA1 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TUBB2BQ9BVA1 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TUBB2BQ9BVA1 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TUBB2BQ9BVA1 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TUBB2BQ9BVA1 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TUBB2BQ9BVA1 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TUBB2BQ9BVA1 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TUBB2BQ9BVA1 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TUBB2BQ9BVA1 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TUBB2BQ9BVA1 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TUBB2BQ9BVA1 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TUBB2BQ9BVA1 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TUBB2BQ9BVA1 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TUBB2BQ9BVA1 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TUBB2BQ9BVA1 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TUBB2BQ9BVA1 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms