Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUK0

CHCHD7, Coiled-coil-helix-coiled-coil-helix domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 85 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHCHD7Q9BUK0 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CHCHD7Q9BUK0 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CHCHD7Q9BUK0 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CHCHD7Q9BUK0 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CHCHD7Q9BUK0 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CHCHD7Q9BUK0 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CHCHD7Q9BUK0 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CHCHD7Q9BUK0 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CHCHD7Q9BUK0 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CHCHD7Q9BUK0 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CHCHD7Q9BUK0 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CHCHD7Q9BUK0 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CHCHD7Q9BUK0 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
CHCHD7Q9BUK0 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CHCHD7Q9BUK0 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CHCHD7Q9BUK0 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CHCHD7Q9BUK0 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CHCHD7Q9BUK0 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CHCHD7Q9BUK0 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CHCHD7Q9BUK0 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CHCHD7Q9BUK0 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CHCHD7Q9BUK0 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CHCHD7Q9BUK0 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CHCHD7Q9BUK0 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CHCHD7Q9BUK0 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CHCHD7Q9BUK0 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CHCHD7Q9BUK0 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CHCHD7Q9BUK0 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CHCHD7Q9BUK0 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CHCHD7Q9BUK0 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CHCHD7Q9BUK0 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CHCHD7Q9BUK0 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CHCHD7Q9BUK0 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
CHCHD7Q9BUK0 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CHCHD7Q9BUK0 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CHCHD7Q9BUK0 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
CHCHD7Q9BUK0 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CHCHD7Q9BUK0 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
CHCHD7Q9BUK0 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
CHCHD7Q9BUK0 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CHCHD7Q9BUK0 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CHCHD7Q9BUK0 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CHCHD7Q9BUK0 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CHCHD7Q9BUK0 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
CHCHD7Q9BUK0 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
CHCHD7Q9BUK0 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
CHCHD7Q9BUK0 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
CHCHD7Q9BUK0 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CHCHD7Q9BUK0 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CHCHD7Q9BUK0 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CHCHD7Q9BUK0 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CHCHD7Q9BUK0 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CHCHD7Q9BUK0 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CHCHD7Q9BUK0 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CHCHD7Q9BUK0 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CHCHD7Q9BUK0 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CHCHD7Q9BUK0 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CHCHD7Q9BUK0 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CHCHD7Q9BUK0 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
CHCHD7Q9BUK0 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CHCHD7Q9BUK0 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CHCHD7Q9BUK0 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CHCHD7Q9BUK0 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CHCHD7Q9BUK0 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CHCHD7Q9BUK0 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CHCHD7Q9BUK0 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CHCHD7Q9BUK0 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CHCHD7Q9BUK0 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CHCHD7Q9BUK0 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CHCHD7Q9BUK0 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CHCHD7Q9BUK0 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CHCHD7Q9BUK0 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CHCHD7Q9BUK0 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CHCHD7Q9BUK0 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CHCHD7Q9BUK0 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CHCHD7Q9BUK0 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CHCHD7Q9BUK0 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CHCHD7Q9BUK0 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CHCHD7Q9BUK0 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CHCHD7Q9BUK0 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
CHCHD7Q9BUK0 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
CHCHD7Q9BUK0 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
CHCHD7Q9BUK0 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CHCHD7Q9BUK0 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CHCHD7Q9BUK0 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CHCHD7Q9BUK0 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CHCHD7Q9BUK0 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CHCHD7Q9BUK0 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CHCHD7Q9BUK0 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CHCHD7Q9BUK0 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CHCHD7Q9BUK0 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CHCHD7Q9BUK0 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CHCHD7Q9BUK0 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CHCHD7Q9BUK0 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CHCHD7Q9BUK0 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
CHCHD7Q9BUK0 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CHCHD7Q9BUK0 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CHCHD7Q9BUK0 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CHCHD7Q9BUK0 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CHCHD7Q9BUK0 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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