Protein–RNA interactions for Protein: Q9BST9

RTKN, Rhotekin, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTKNQ9BST9 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RTKNQ9BST9 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RTKNQ9BST9 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RTKNQ9BST9 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
RTKNQ9BST9 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RTKNQ9BST9 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RTKNQ9BST9 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RTKNQ9BST9 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RTKNQ9BST9 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RTKNQ9BST9 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
RTKNQ9BST9 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RTKNQ9BST9 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RTKNQ9BST9 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RTKNQ9BST9 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RTKNQ9BST9 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
RTKNQ9BST9 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RTKNQ9BST9 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RTKNQ9BST9 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RTKNQ9BST9 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RTKNQ9BST9 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RTKNQ9BST9 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RTKNQ9BST9 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RTKNQ9BST9 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RTKNQ9BST9 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RTKNQ9BST9 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RTKNQ9BST9 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
RTKNQ9BST9 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RTKNQ9BST9 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
RTKNQ9BST9 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RTKNQ9BST9 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RTKNQ9BST9 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RTKNQ9BST9 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RTKNQ9BST9 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RTKNQ9BST9 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RTKNQ9BST9 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RTKNQ9BST9 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RTKNQ9BST9 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RTKNQ9BST9 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
RTKNQ9BST9 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RTKNQ9BST9 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
RTKNQ9BST9 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RTKNQ9BST9 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RTKNQ9BST9 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RTKNQ9BST9 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RTKNQ9BST9 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RTKNQ9BST9 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RTKNQ9BST9 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RTKNQ9BST9 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RTKNQ9BST9 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RTKNQ9BST9 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RTKNQ9BST9 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RTKNQ9BST9 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RTKNQ9BST9 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RTKNQ9BST9 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RTKNQ9BST9 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RTKNQ9BST9 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RTKNQ9BST9 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RTKNQ9BST9 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
RTKNQ9BST9 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RTKNQ9BST9 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RTKNQ9BST9 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RTKNQ9BST9 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RTKNQ9BST9 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RTKNQ9BST9 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RTKNQ9BST9 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RTKNQ9BST9 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RTKNQ9BST9 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RTKNQ9BST9 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RTKNQ9BST9 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
RTKNQ9BST9 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
RTKNQ9BST9 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RTKNQ9BST9 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RTKNQ9BST9 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RTKNQ9BST9 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
RTKNQ9BST9 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
RTKNQ9BST9 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
RTKNQ9BST9 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
RTKNQ9BST9 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RTKNQ9BST9 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RTKNQ9BST9 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RTKNQ9BST9 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RTKNQ9BST9 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RTKNQ9BST9 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RTKNQ9BST9 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RTKNQ9BST9 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RTKNQ9BST9 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RTKNQ9BST9 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RTKNQ9BST9 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RTKNQ9BST9 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RTKNQ9BST9 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RTKNQ9BST9 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RTKNQ9BST9 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RTKNQ9BST9 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RTKNQ9BST9 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RTKNQ9BST9 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RTKNQ9BST9 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RTKNQ9BST9 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RTKNQ9BST9 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RTKNQ9BST9 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RTKNQ9BST9 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms