Protein–RNA interactions for Protein: Q99952

PTPN18, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 18, humanhuman

Predictions only

Length 460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN18Q99952 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PTPN18Q99952 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
PTPN18Q99952 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PTPN18Q99952 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PTPN18Q99952 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PTPN18Q99952 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PTPN18Q99952 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PTPN18Q99952 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PTPN18Q99952 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PTPN18Q99952 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PTPN18Q99952 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PTPN18Q99952 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PTPN18Q99952 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PTPN18Q99952 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PTPN18Q99952 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PTPN18Q99952 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PTPN18Q99952 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PTPN18Q99952 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PTPN18Q99952 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PTPN18Q99952 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PTPN18Q99952 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
PTPN18Q99952 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PTPN18Q99952 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
PTPN18Q99952 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PTPN18Q99952 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PTPN18Q99952 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PTPN18Q99952 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PTPN18Q99952 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PTPN18Q99952 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PTPN18Q99952 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PTPN18Q99952 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PTPN18Q99952 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
PTPN18Q99952 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PTPN18Q99952 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PTPN18Q99952 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PTPN18Q99952 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PTPN18Q99952 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PTPN18Q99952 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PTPN18Q99952 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PTPN18Q99952 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PTPN18Q99952 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PTPN18Q99952 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PTPN18Q99952 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PTPN18Q99952 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PTPN18Q99952 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PTPN18Q99952 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PTPN18Q99952 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PTPN18Q99952 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PTPN18Q99952 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PTPN18Q99952 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PTPN18Q99952 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PTPN18Q99952 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PTPN18Q99952 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PTPN18Q99952 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PTPN18Q99952 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PTPN18Q99952 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PTPN18Q99952 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PTPN18Q99952 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PTPN18Q99952 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
PTPN18Q99952 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PTPN18Q99952 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PTPN18Q99952 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PTPN18Q99952 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PTPN18Q99952 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PTPN18Q99952 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PTPN18Q99952 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
PTPN18Q99952 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PTPN18Q99952 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PTPN18Q99952 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PTPN18Q99952 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PTPN18Q99952 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PTPN18Q99952 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PTPN18Q99952 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
PTPN18Q99952 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PTPN18Q99952 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PTPN18Q99952 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PTPN18Q99952 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
PTPN18Q99952 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PTPN18Q99952 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PTPN18Q99952 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PTPN18Q99952 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
PTPN18Q99952 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PTPN18Q99952 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PTPN18Q99952 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PTPN18Q99952 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PTPN18Q99952 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PTPN18Q99952 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PTPN18Q99952 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PTPN18Q99952 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PTPN18Q99952 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PTPN18Q99952 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
PTPN18Q99952 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PTPN18Q99952 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PTPN18Q99952 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PTPN18Q99952 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PTPN18Q99952 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
PTPN18Q99952 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
PTPN18Q99952 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
PTPN18Q99952 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
PTPN18Q99952 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms