Protein–RNA interactions for Protein: Q99758

ABCA3, ATP-binding cassette sub-family A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,704 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCA3Q99758 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
ABCA3Q99758 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
ABCA3Q99758 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
ABCA3Q99758 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
ABCA3Q99758 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
ABCA3Q99758 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
ABCA3Q99758 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
ABCA3Q99758 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
ABCA3Q99758 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
ABCA3Q99758 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
ABCA3Q99758 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
ABCA3Q99758 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
ABCA3Q99758 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
ABCA3Q99758 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
ABCA3Q99758 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
ABCA3Q99758 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
ABCA3Q99758 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
ABCA3Q99758 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
ABCA3Q99758 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
ABCA3Q99758 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
ABCA3Q99758 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
ABCA3Q99758 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
ABCA3Q99758 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
ABCA3Q99758 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
ABCA3Q99758 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
ABCA3Q99758 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
ABCA3Q99758 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
ABCA3Q99758 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
ABCA3Q99758 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
ABCA3Q99758 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
ABCA3Q99758 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
ABCA3Q99758 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
ABCA3Q99758 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
ABCA3Q99758 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
ABCA3Q99758 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
ABCA3Q99758 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC28.85■■■□□ 2.21
ABCA3Q99758 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
ABCA3Q99758 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC28.85■■■□□ 2.21
ABCA3Q99758 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
ABCA3Q99758 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
ABCA3Q99758 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
ABCA3Q99758 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
ABCA3Q99758 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
ABCA3Q99758 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
ABCA3Q99758 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
ABCA3Q99758 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
ABCA3Q99758 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
ABCA3Q99758 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
ABCA3Q99758 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
ABCA3Q99758 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
ABCA3Q99758 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
ABCA3Q99758 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
ABCA3Q99758 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
ABCA3Q99758 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
ABCA3Q99758 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
ABCA3Q99758 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
ABCA3Q99758 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
ABCA3Q99758 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC28.83■■■□□ 2.21
ABCA3Q99758 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
ABCA3Q99758 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
ABCA3Q99758 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
ABCA3Q99758 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
ABCA3Q99758 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
ABCA3Q99758 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
ABCA3Q99758 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
ABCA3Q99758 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
ABCA3Q99758 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
ABCA3Q99758 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
ABCA3Q99758 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC28.81■■■□□ 2.2
ABCA3Q99758 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
ABCA3Q99758 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
ABCA3Q99758 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC28.81■■■□□ 2.2
ABCA3Q99758 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
ABCA3Q99758 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
ABCA3Q99758 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
ABCA3Q99758 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
ABCA3Q99758 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
ABCA3Q99758 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
ABCA3Q99758 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
ABCA3Q99758 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
ABCA3Q99758 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
ABCA3Q99758 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
ABCA3Q99758 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
ABCA3Q99758 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
ABCA3Q99758 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
ABCA3Q99758 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
ABCA3Q99758 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
ABCA3Q99758 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
ABCA3Q99758 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
ABCA3Q99758 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
ABCA3Q99758 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
ABCA3Q99758 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
ABCA3Q99758 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
ABCA3Q99758 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
ABCA3Q99758 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
ABCA3Q99758 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
ABCA3Q99758 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
ABCA3Q99758 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
ABCA3Q99758 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
ABCA3Q99758 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms