Protein–RNA interactions for Protein: Q99687

MEIS3, Homeobox protein Meis3, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEIS3Q99687 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
MEIS3Q99687 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
MEIS3Q99687 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
MEIS3Q99687 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
MEIS3Q99687 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
MEIS3Q99687 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
MEIS3Q99687 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
MEIS3Q99687 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
MEIS3Q99687 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
MEIS3Q99687 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
MEIS3Q99687 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
MEIS3Q99687 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
MEIS3Q99687 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
MEIS3Q99687 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC26.85■■□□□ 1.89
MEIS3Q99687 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
MEIS3Q99687 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
MEIS3Q99687 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
MEIS3Q99687 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
MEIS3Q99687 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
MEIS3Q99687 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
MEIS3Q99687 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
MEIS3Q99687 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
MEIS3Q99687 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
MEIS3Q99687 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
MEIS3Q99687 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
MEIS3Q99687 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
MEIS3Q99687 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
MEIS3Q99687 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
MEIS3Q99687 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
MEIS3Q99687 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
MEIS3Q99687 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
MEIS3Q99687 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
MEIS3Q99687 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
MEIS3Q99687 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
MEIS3Q99687 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
MEIS3Q99687 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
MEIS3Q99687 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
MEIS3Q99687 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
MEIS3Q99687 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
MEIS3Q99687 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
MEIS3Q99687 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
MEIS3Q99687 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
MEIS3Q99687 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
MEIS3Q99687 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
MEIS3Q99687 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
MEIS3Q99687 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
MEIS3Q99687 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
MEIS3Q99687 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
MEIS3Q99687 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
MEIS3Q99687 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
MEIS3Q99687 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
MEIS3Q99687 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
MEIS3Q99687 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
MEIS3Q99687 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
MEIS3Q99687 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
MEIS3Q99687 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
MEIS3Q99687 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
MEIS3Q99687 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
MEIS3Q99687 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
MEIS3Q99687 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
MEIS3Q99687 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
MEIS3Q99687 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
MEIS3Q99687 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
MEIS3Q99687 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
MEIS3Q99687 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
MEIS3Q99687 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
MEIS3Q99687 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
MEIS3Q99687 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
MEIS3Q99687 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
MEIS3Q99687 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
MEIS3Q99687 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
MEIS3Q99687 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
MEIS3Q99687 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
MEIS3Q99687 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
MEIS3Q99687 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
MEIS3Q99687 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
MEIS3Q99687 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
MEIS3Q99687 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
MEIS3Q99687 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
MEIS3Q99687 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
MEIS3Q99687 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
MEIS3Q99687 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
MEIS3Q99687 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
MEIS3Q99687 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
MEIS3Q99687 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
MEIS3Q99687 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
MEIS3Q99687 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
MEIS3Q99687 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
MEIS3Q99687 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
MEIS3Q99687 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
MEIS3Q99687 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
MEIS3Q99687 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
MEIS3Q99687 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
MEIS3Q99687 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
MEIS3Q99687 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
MEIS3Q99687 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
MEIS3Q99687 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
MEIS3Q99687 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
MEIS3Q99687 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
MEIS3Q99687 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms