Protein–RNA interactions for Protein: Q96T51

RUFY1, RUN and FYVE domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUFY1Q96T51 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RUFY1Q96T51 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RUFY1Q96T51 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RUFY1Q96T51 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RUFY1Q96T51 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RUFY1Q96T51 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RUFY1Q96T51 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RUFY1Q96T51 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RUFY1Q96T51 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RUFY1Q96T51 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RUFY1Q96T51 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RUFY1Q96T51 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
RUFY1Q96T51 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RUFY1Q96T51 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RUFY1Q96T51 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
RUFY1Q96T51 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RUFY1Q96T51 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RUFY1Q96T51 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RUFY1Q96T51 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RUFY1Q96T51 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RUFY1Q96T51 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RUFY1Q96T51 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RUFY1Q96T51 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
RUFY1Q96T51 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RUFY1Q96T51 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RUFY1Q96T51 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RUFY1Q96T51 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
RUFY1Q96T51 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RUFY1Q96T51 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RUFY1Q96T51 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RUFY1Q96T51 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RUFY1Q96T51 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RUFY1Q96T51 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RUFY1Q96T51 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RUFY1Q96T51 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RUFY1Q96T51 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RUFY1Q96T51 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RUFY1Q96T51 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RUFY1Q96T51 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RUFY1Q96T51 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RUFY1Q96T51 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
RUFY1Q96T51 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RUFY1Q96T51 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RUFY1Q96T51 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RUFY1Q96T51 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RUFY1Q96T51 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RUFY1Q96T51 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RUFY1Q96T51 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RUFY1Q96T51 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RUFY1Q96T51 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RUFY1Q96T51 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RUFY1Q96T51 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RUFY1Q96T51 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RUFY1Q96T51 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RUFY1Q96T51 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RUFY1Q96T51 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RUFY1Q96T51 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RUFY1Q96T51 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RUFY1Q96T51 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RUFY1Q96T51 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RUFY1Q96T51 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RUFY1Q96T51 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RUFY1Q96T51 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RUFY1Q96T51 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RUFY1Q96T51 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RUFY1Q96T51 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RUFY1Q96T51 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RUFY1Q96T51 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RUFY1Q96T51 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RUFY1Q96T51 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RUFY1Q96T51 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RUFY1Q96T51 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RUFY1Q96T51 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RUFY1Q96T51 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RUFY1Q96T51 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RUFY1Q96T51 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RUFY1Q96T51 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RUFY1Q96T51 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RUFY1Q96T51 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RUFY1Q96T51 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RUFY1Q96T51 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RUFY1Q96T51 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RUFY1Q96T51 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RUFY1Q96T51 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RUFY1Q96T51 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RUFY1Q96T51 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RUFY1Q96T51 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RUFY1Q96T51 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RUFY1Q96T51 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RUFY1Q96T51 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RUFY1Q96T51 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
RUFY1Q96T51 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RUFY1Q96T51 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RUFY1Q96T51 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RUFY1Q96T51 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RUFY1Q96T51 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
RUFY1Q96T51 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RUFY1Q96T51 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
RUFY1Q96T51 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RUFY1Q96T51 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms