Protein–RNA interactions for Protein: Q96SW2

CRBN, Protein cereblon, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRBNQ96SW2 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CRBNQ96SW2 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CRBNQ96SW2 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CRBNQ96SW2 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CRBNQ96SW2 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CRBNQ96SW2 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CRBNQ96SW2 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CRBNQ96SW2 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CRBNQ96SW2 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CRBNQ96SW2 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CRBNQ96SW2 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CRBNQ96SW2 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CRBNQ96SW2 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CRBNQ96SW2 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CRBNQ96SW2 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CRBNQ96SW2 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CRBNQ96SW2 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CRBNQ96SW2 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
CRBNQ96SW2 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
CRBNQ96SW2 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CRBNQ96SW2 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
CRBNQ96SW2 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CRBNQ96SW2 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
CRBNQ96SW2 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CRBNQ96SW2 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CRBNQ96SW2 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CRBNQ96SW2 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
CRBNQ96SW2 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CRBNQ96SW2 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CRBNQ96SW2 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CRBNQ96SW2 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CRBNQ96SW2 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CRBNQ96SW2 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CRBNQ96SW2 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CRBNQ96SW2 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CRBNQ96SW2 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CRBNQ96SW2 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
CRBNQ96SW2 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CRBNQ96SW2 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CRBNQ96SW2 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CRBNQ96SW2 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CRBNQ96SW2 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
CRBNQ96SW2 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
CRBNQ96SW2 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
CRBNQ96SW2 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
CRBNQ96SW2 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CRBNQ96SW2 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CRBNQ96SW2 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CRBNQ96SW2 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CRBNQ96SW2 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CRBNQ96SW2 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
CRBNQ96SW2 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CRBNQ96SW2 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CRBNQ96SW2 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CRBNQ96SW2 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CRBNQ96SW2 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CRBNQ96SW2 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CRBNQ96SW2 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CRBNQ96SW2 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CRBNQ96SW2 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CRBNQ96SW2 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CRBNQ96SW2 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CRBNQ96SW2 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CRBNQ96SW2 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CRBNQ96SW2 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CRBNQ96SW2 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CRBNQ96SW2 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
CRBNQ96SW2 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CRBNQ96SW2 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CRBNQ96SW2 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CRBNQ96SW2 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CRBNQ96SW2 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CRBNQ96SW2 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CRBNQ96SW2 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CRBNQ96SW2 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
CRBNQ96SW2 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CRBNQ96SW2 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CRBNQ96SW2 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
CRBNQ96SW2 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CRBNQ96SW2 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CRBNQ96SW2 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CRBNQ96SW2 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CRBNQ96SW2 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CRBNQ96SW2 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CRBNQ96SW2 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CRBNQ96SW2 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CRBNQ96SW2 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CRBNQ96SW2 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CRBNQ96SW2 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CRBNQ96SW2 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CRBNQ96SW2 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CRBNQ96SW2 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CRBNQ96SW2 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CRBNQ96SW2 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CRBNQ96SW2 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CRBNQ96SW2 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CRBNQ96SW2 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CRBNQ96SW2 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CRBNQ96SW2 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CRBNQ96SW2 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms