Protein–RNA interactions for Protein: Q96S38

RPS6KC1, Ribosomal protein S6 kinase delta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KC1Q96S38 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RPS6KC1Q96S38 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RPS6KC1Q96S38 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RPS6KC1Q96S38 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
RPS6KC1Q96S38 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RPS6KC1Q96S38 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RPS6KC1Q96S38 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RPS6KC1Q96S38 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RPS6KC1Q96S38 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RPS6KC1Q96S38 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RPS6KC1Q96S38 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RPS6KC1Q96S38 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RPS6KC1Q96S38 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RPS6KC1Q96S38 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RPS6KC1Q96S38 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RPS6KC1Q96S38 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RPS6KC1Q96S38 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RPS6KC1Q96S38 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RPS6KC1Q96S38 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
RPS6KC1Q96S38 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RPS6KC1Q96S38 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RPS6KC1Q96S38 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RPS6KC1Q96S38 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RPS6KC1Q96S38 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RPS6KC1Q96S38 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RPS6KC1Q96S38 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RPS6KC1Q96S38 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RPS6KC1Q96S38 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
RPS6KC1Q96S38 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RPS6KC1Q96S38 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RPS6KC1Q96S38 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RPS6KC1Q96S38 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RPS6KC1Q96S38 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RPS6KC1Q96S38 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RPS6KC1Q96S38 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
RPS6KC1Q96S38 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RPS6KC1Q96S38 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RPS6KC1Q96S38 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RPS6KC1Q96S38 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RPS6KC1Q96S38 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RPS6KC1Q96S38 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RPS6KC1Q96S38 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RPS6KC1Q96S38 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RPS6KC1Q96S38 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RPS6KC1Q96S38 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RPS6KC1Q96S38 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RPS6KC1Q96S38 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RPS6KC1Q96S38 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RPS6KC1Q96S38 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RPS6KC1Q96S38 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RPS6KC1Q96S38 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RPS6KC1Q96S38 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RPS6KC1Q96S38 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RPS6KC1Q96S38 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RPS6KC1Q96S38 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RPS6KC1Q96S38 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RPS6KC1Q96S38 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RPS6KC1Q96S38 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RPS6KC1Q96S38 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
RPS6KC1Q96S38 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
RPS6KC1Q96S38 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
RPS6KC1Q96S38 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RPS6KC1Q96S38 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
RPS6KC1Q96S38 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
RPS6KC1Q96S38 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RPS6KC1Q96S38 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RPS6KC1Q96S38 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RPS6KC1Q96S38 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RPS6KC1Q96S38 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
RPS6KC1Q96S38 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
RPS6KC1Q96S38 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
RPS6KC1Q96S38 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RPS6KC1Q96S38 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RPS6KC1Q96S38 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RPS6KC1Q96S38 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RPS6KC1Q96S38 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RPS6KC1Q96S38 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RPS6KC1Q96S38 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RPS6KC1Q96S38 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RPS6KC1Q96S38 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RPS6KC1Q96S38 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RPS6KC1Q96S38 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RPS6KC1Q96S38 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RPS6KC1Q96S38 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RPS6KC1Q96S38 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RPS6KC1Q96S38 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RPS6KC1Q96S38 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RPS6KC1Q96S38 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RPS6KC1Q96S38 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RPS6KC1Q96S38 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RPS6KC1Q96S38 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RPS6KC1Q96S38 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RPS6KC1Q96S38 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RPS6KC1Q96S38 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RPS6KC1Q96S38 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RPS6KC1Q96S38 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RPS6KC1Q96S38 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RPS6KC1Q96S38 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RPS6KC1Q96S38 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RPS6KC1Q96S38 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.6 ms