Protein–RNA interactions for Protein: Q96RS0

TGS1, Trimethylguanosine synthase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 853 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGS1Q96RS0 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TGS1Q96RS0 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TGS1Q96RS0 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TGS1Q96RS0 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TGS1Q96RS0 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TGS1Q96RS0 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TGS1Q96RS0 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TGS1Q96RS0 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TGS1Q96RS0 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
TGS1Q96RS0 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TGS1Q96RS0 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TGS1Q96RS0 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TGS1Q96RS0 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TGS1Q96RS0 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TGS1Q96RS0 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TGS1Q96RS0 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TGS1Q96RS0 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TGS1Q96RS0 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TGS1Q96RS0 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TGS1Q96RS0 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TGS1Q96RS0 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TGS1Q96RS0 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TGS1Q96RS0 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TGS1Q96RS0 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
TGS1Q96RS0 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TGS1Q96RS0 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TGS1Q96RS0 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TGS1Q96RS0 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TGS1Q96RS0 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TGS1Q96RS0 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TGS1Q96RS0 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TGS1Q96RS0 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TGS1Q96RS0 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TGS1Q96RS0 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TGS1Q96RS0 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TGS1Q96RS0 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
TGS1Q96RS0 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
TGS1Q96RS0 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TGS1Q96RS0 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TGS1Q96RS0 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TGS1Q96RS0 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TGS1Q96RS0 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TGS1Q96RS0 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TGS1Q96RS0 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TGS1Q96RS0 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TGS1Q96RS0 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TGS1Q96RS0 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TGS1Q96RS0 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TGS1Q96RS0 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TGS1Q96RS0 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TGS1Q96RS0 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.31
TGS1Q96RS0 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.31
TGS1Q96RS0 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
TGS1Q96RS0 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TGS1Q96RS0 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TGS1Q96RS0 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TGS1Q96RS0 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TGS1Q96RS0 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TGS1Q96RS0 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TGS1Q96RS0 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TGS1Q96RS0 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TGS1Q96RS0 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
TGS1Q96RS0 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TGS1Q96RS0 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TGS1Q96RS0 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TGS1Q96RS0 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TGS1Q96RS0 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TGS1Q96RS0 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TGS1Q96RS0 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TGS1Q96RS0 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TGS1Q96RS0 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TGS1Q96RS0 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TGS1Q96RS0 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TGS1Q96RS0 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TGS1Q96RS0 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TGS1Q96RS0 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TGS1Q96RS0 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TGS1Q96RS0 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TGS1Q96RS0 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TGS1Q96RS0 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TGS1Q96RS0 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TGS1Q96RS0 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
TGS1Q96RS0 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TGS1Q96RS0 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TGS1Q96RS0 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TGS1Q96RS0 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TGS1Q96RS0 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TGS1Q96RS0 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TGS1Q96RS0 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
TGS1Q96RS0 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TGS1Q96RS0 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TGS1Q96RS0 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TGS1Q96RS0 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TGS1Q96RS0 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TGS1Q96RS0 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TGS1Q96RS0 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TGS1Q96RS0 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TGS1Q96RS0 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TGS1Q96RS0 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TGS1Q96RS0 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms