Protein–RNA interactions for Protein: Q96PX6

CCDC85A, Coiled-coil domain-containing protein 85A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85AQ96PX6 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CCDC85AQ96PX6 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CCDC85AQ96PX6 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CCDC85AQ96PX6 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
CCDC85AQ96PX6 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CCDC85AQ96PX6 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CCDC85AQ96PX6 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CCDC85AQ96PX6 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
CCDC85AQ96PX6 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CCDC85AQ96PX6 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CCDC85AQ96PX6 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CCDC85AQ96PX6 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CCDC85AQ96PX6 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CCDC85AQ96PX6 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CCDC85AQ96PX6 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CCDC85AQ96PX6 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CCDC85AQ96PX6 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CCDC85AQ96PX6 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CCDC85AQ96PX6 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CCDC85AQ96PX6 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CCDC85AQ96PX6 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CCDC85AQ96PX6 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CCDC85AQ96PX6 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CCDC85AQ96PX6 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CCDC85AQ96PX6 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CCDC85AQ96PX6 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CCDC85AQ96PX6 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CCDC85AQ96PX6 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
CCDC85AQ96PX6 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CCDC85AQ96PX6 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CCDC85AQ96PX6 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CCDC85AQ96PX6 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CCDC85AQ96PX6 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CCDC85AQ96PX6 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CCDC85AQ96PX6 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CCDC85AQ96PX6 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CCDC85AQ96PX6 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CCDC85AQ96PX6 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CCDC85AQ96PX6 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CCDC85AQ96PX6 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
CCDC85AQ96PX6 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
CCDC85AQ96PX6 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CCDC85AQ96PX6 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CCDC85AQ96PX6 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
CCDC85AQ96PX6 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CCDC85AQ96PX6 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CCDC85AQ96PX6 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CCDC85AQ96PX6 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CCDC85AQ96PX6 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CCDC85AQ96PX6 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CCDC85AQ96PX6 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CCDC85AQ96PX6 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CCDC85AQ96PX6 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CCDC85AQ96PX6 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CCDC85AQ96PX6 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CCDC85AQ96PX6 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CCDC85AQ96PX6 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CCDC85AQ96PX6 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CCDC85AQ96PX6 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CCDC85AQ96PX6 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CCDC85AQ96PX6 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
CCDC85AQ96PX6 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CCDC85AQ96PX6 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CCDC85AQ96PX6 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CCDC85AQ96PX6 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CCDC85AQ96PX6 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
CCDC85AQ96PX6 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CCDC85AQ96PX6 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CCDC85AQ96PX6 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CCDC85AQ96PX6 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CCDC85AQ96PX6 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CCDC85AQ96PX6 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CCDC85AQ96PX6 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CCDC85AQ96PX6 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CCDC85AQ96PX6 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CCDC85AQ96PX6 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CCDC85AQ96PX6 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CCDC85AQ96PX6 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CCDC85AQ96PX6 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CCDC85AQ96PX6 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
CCDC85AQ96PX6 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
CCDC85AQ96PX6 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CCDC85AQ96PX6 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CCDC85AQ96PX6 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CCDC85AQ96PX6 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CCDC85AQ96PX6 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CCDC85AQ96PX6 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CCDC85AQ96PX6 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CCDC85AQ96PX6 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CCDC85AQ96PX6 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CCDC85AQ96PX6 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CCDC85AQ96PX6 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CCDC85AQ96PX6 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CCDC85AQ96PX6 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CCDC85AQ96PX6 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CCDC85AQ96PX6 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CCDC85AQ96PX6 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CCDC85AQ96PX6 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CCDC85AQ96PX6 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CCDC85AQ96PX6 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms