Protein–RNA interactions for Protein: Q96PV0

SYNGAP1, Ras/Rap GTPase-activating protein SynGAP, humanhuman

Predictions only

Length 1,343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNGAP1Q96PV0 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SYNGAP1Q96PV0 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SYNGAP1Q96PV0 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SYNGAP1Q96PV0 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SYNGAP1Q96PV0 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SYNGAP1Q96PV0 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SYNGAP1Q96PV0 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SYNGAP1Q96PV0 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SYNGAP1Q96PV0 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SYNGAP1Q96PV0 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
SYNGAP1Q96PV0 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SYNGAP1Q96PV0 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SYNGAP1Q96PV0 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SYNGAP1Q96PV0 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
SYNGAP1Q96PV0 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SYNGAP1Q96PV0 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SYNGAP1Q96PV0 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SYNGAP1Q96PV0 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
SYNGAP1Q96PV0 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SYNGAP1Q96PV0 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SYNGAP1Q96PV0 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SYNGAP1Q96PV0 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SYNGAP1Q96PV0 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SYNGAP1Q96PV0 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SYNGAP1Q96PV0 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SYNGAP1Q96PV0 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
SYNGAP1Q96PV0 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SYNGAP1Q96PV0 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SYNGAP1Q96PV0 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SYNGAP1Q96PV0 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SYNGAP1Q96PV0 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SYNGAP1Q96PV0 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SYNGAP1Q96PV0 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SYNGAP1Q96PV0 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SYNGAP1Q96PV0 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SYNGAP1Q96PV0 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SYNGAP1Q96PV0 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SYNGAP1Q96PV0 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
SYNGAP1Q96PV0 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
SYNGAP1Q96PV0 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SYNGAP1Q96PV0 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SYNGAP1Q96PV0 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SYNGAP1Q96PV0 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SYNGAP1Q96PV0 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SYNGAP1Q96PV0 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SYNGAP1Q96PV0 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
SYNGAP1Q96PV0 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SYNGAP1Q96PV0 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SYNGAP1Q96PV0 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SYNGAP1Q96PV0 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SYNGAP1Q96PV0 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SYNGAP1Q96PV0 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SYNGAP1Q96PV0 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SYNGAP1Q96PV0 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SYNGAP1Q96PV0 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SYNGAP1Q96PV0 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SYNGAP1Q96PV0 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SYNGAP1Q96PV0 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SYNGAP1Q96PV0 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SYNGAP1Q96PV0 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SYNGAP1Q96PV0 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SYNGAP1Q96PV0 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
SYNGAP1Q96PV0 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SYNGAP1Q96PV0 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SYNGAP1Q96PV0 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
SYNGAP1Q96PV0 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
SYNGAP1Q96PV0 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SYNGAP1Q96PV0 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SYNGAP1Q96PV0 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SYNGAP1Q96PV0 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SYNGAP1Q96PV0 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SYNGAP1Q96PV0 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SYNGAP1Q96PV0 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SYNGAP1Q96PV0 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
SYNGAP1Q96PV0 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SYNGAP1Q96PV0 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SYNGAP1Q96PV0 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
SYNGAP1Q96PV0 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SYNGAP1Q96PV0 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SYNGAP1Q96PV0 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SYNGAP1Q96PV0 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
SYNGAP1Q96PV0 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SYNGAP1Q96PV0 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SYNGAP1Q96PV0 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SYNGAP1Q96PV0 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SYNGAP1Q96PV0 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SYNGAP1Q96PV0 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SYNGAP1Q96PV0 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SYNGAP1Q96PV0 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SYNGAP1Q96PV0 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SYNGAP1Q96PV0 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SYNGAP1Q96PV0 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
SYNGAP1Q96PV0 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SYNGAP1Q96PV0 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SYNGAP1Q96PV0 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
SYNGAP1Q96PV0 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SYNGAP1Q96PV0 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SYNGAP1Q96PV0 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
SYNGAP1Q96PV0 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SYNGAP1Q96PV0 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.8 ms