Protein–RNA interactions for Protein: Q96P71

NECAB3, N-terminal EF-hand calcium-binding protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NECAB3Q96P71 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NECAB3Q96P71 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NECAB3Q96P71 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NECAB3Q96P71 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NECAB3Q96P71 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NECAB3Q96P71 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NECAB3Q96P71 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NECAB3Q96P71 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NECAB3Q96P71 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NECAB3Q96P71 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NECAB3Q96P71 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NECAB3Q96P71 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NECAB3Q96P71 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NECAB3Q96P71 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NECAB3Q96P71 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NECAB3Q96P71 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NECAB3Q96P71 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NECAB3Q96P71 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
NECAB3Q96P71 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NECAB3Q96P71 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NECAB3Q96P71 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NECAB3Q96P71 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NECAB3Q96P71 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NECAB3Q96P71 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NECAB3Q96P71 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NECAB3Q96P71 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NECAB3Q96P71 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NECAB3Q96P71 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NECAB3Q96P71 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NECAB3Q96P71 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NECAB3Q96P71 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NECAB3Q96P71 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NECAB3Q96P71 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NECAB3Q96P71 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NECAB3Q96P71 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NECAB3Q96P71 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NECAB3Q96P71 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NECAB3Q96P71 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NECAB3Q96P71 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NECAB3Q96P71 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
NECAB3Q96P71 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NECAB3Q96P71 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NECAB3Q96P71 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
NECAB3Q96P71 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NECAB3Q96P71 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NECAB3Q96P71 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NECAB3Q96P71 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NECAB3Q96P71 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
NECAB3Q96P71 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
NECAB3Q96P71 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
NECAB3Q96P71 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NECAB3Q96P71 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NECAB3Q96P71 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NECAB3Q96P71 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NECAB3Q96P71 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NECAB3Q96P71 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NECAB3Q96P71 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NECAB3Q96P71 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NECAB3Q96P71 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NECAB3Q96P71 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NECAB3Q96P71 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NECAB3Q96P71 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NECAB3Q96P71 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NECAB3Q96P71 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NECAB3Q96P71 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NECAB3Q96P71 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NECAB3Q96P71 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NECAB3Q96P71 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NECAB3Q96P71 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NECAB3Q96P71 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NECAB3Q96P71 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NECAB3Q96P71 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NECAB3Q96P71 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NECAB3Q96P71 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NECAB3Q96P71 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NECAB3Q96P71 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NECAB3Q96P71 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NECAB3Q96P71 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NECAB3Q96P71 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NECAB3Q96P71 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NECAB3Q96P71 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
NECAB3Q96P71 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NECAB3Q96P71 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NECAB3Q96P71 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
NECAB3Q96P71 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NECAB3Q96P71 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NECAB3Q96P71 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NECAB3Q96P71 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NECAB3Q96P71 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NECAB3Q96P71 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NECAB3Q96P71 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NECAB3Q96P71 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NECAB3Q96P71 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NECAB3Q96P71 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NECAB3Q96P71 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NECAB3Q96P71 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NECAB3Q96P71 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
NECAB3Q96P71 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NECAB3Q96P71 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NECAB3Q96P71 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.1 ms