Protein–RNA interactions for Protein: Q96NA2

RILP, Rab-interacting lysosomal protein, humanhuman

Predictions only

Length 401 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RILPQ96NA2 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RILPQ96NA2 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RILPQ96NA2 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RILPQ96NA2 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RILPQ96NA2 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RILPQ96NA2 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RILPQ96NA2 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RILPQ96NA2 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RILPQ96NA2 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RILPQ96NA2 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RILPQ96NA2 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RILPQ96NA2 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RILPQ96NA2 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
RILPQ96NA2 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RILPQ96NA2 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RILPQ96NA2 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
RILPQ96NA2 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RILPQ96NA2 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RILPQ96NA2 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RILPQ96NA2 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RILPQ96NA2 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RILPQ96NA2 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RILPQ96NA2 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RILPQ96NA2 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RILPQ96NA2 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RILPQ96NA2 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RILPQ96NA2 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RILPQ96NA2 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RILPQ96NA2 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
RILPQ96NA2 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RILPQ96NA2 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RILPQ96NA2 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RILPQ96NA2 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RILPQ96NA2 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RILPQ96NA2 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RILPQ96NA2 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RILPQ96NA2 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RILPQ96NA2 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RILPQ96NA2 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RILPQ96NA2 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RILPQ96NA2 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RILPQ96NA2 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RILPQ96NA2 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RILPQ96NA2 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RILPQ96NA2 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RILPQ96NA2 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RILPQ96NA2 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
RILPQ96NA2 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RILPQ96NA2 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RILPQ96NA2 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RILPQ96NA2 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RILPQ96NA2 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RILPQ96NA2 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
RILPQ96NA2 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
RILPQ96NA2 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RILPQ96NA2 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RILPQ96NA2 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
RILPQ96NA2 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RILPQ96NA2 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RILPQ96NA2 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RILPQ96NA2 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
RILPQ96NA2 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
RILPQ96NA2 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
RILPQ96NA2 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
RILPQ96NA2 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
RILPQ96NA2 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RILPQ96NA2 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RILPQ96NA2 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RILPQ96NA2 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RILPQ96NA2 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RILPQ96NA2 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RILPQ96NA2 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RILPQ96NA2 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RILPQ96NA2 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RILPQ96NA2 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RILPQ96NA2 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RILPQ96NA2 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RILPQ96NA2 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RILPQ96NA2 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
RILPQ96NA2 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
RILPQ96NA2 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RILPQ96NA2 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
RILPQ96NA2 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RILPQ96NA2 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
RILPQ96NA2 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RILPQ96NA2 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
RILPQ96NA2 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
RILPQ96NA2 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RILPQ96NA2 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RILPQ96NA2 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
RILPQ96NA2 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RILPQ96NA2 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RILPQ96NA2 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RILPQ96NA2 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
RILPQ96NA2 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RILPQ96NA2 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RILPQ96NA2 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RILPQ96NA2 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RILPQ96NA2 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
RILPQ96NA2 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms