Protein–RNA interactions for Protein: Q96MK3

FAM20A, Pseudokinase FAM20A, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM20AQ96MK3 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
FAM20AQ96MK3 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
FAM20AQ96MK3 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
FAM20AQ96MK3 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
FAM20AQ96MK3 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
FAM20AQ96MK3 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
FAM20AQ96MK3 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
FAM20AQ96MK3 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
FAM20AQ96MK3 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
FAM20AQ96MK3 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
FAM20AQ96MK3 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
FAM20AQ96MK3 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
FAM20AQ96MK3 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
FAM20AQ96MK3 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
FAM20AQ96MK3 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
FAM20AQ96MK3 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
FAM20AQ96MK3 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
FAM20AQ96MK3 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
FAM20AQ96MK3 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
FAM20AQ96MK3 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
FAM20AQ96MK3 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
FAM20AQ96MK3 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
FAM20AQ96MK3 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
FAM20AQ96MK3 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
FAM20AQ96MK3 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
FAM20AQ96MK3 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
FAM20AQ96MK3 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
FAM20AQ96MK3 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
FAM20AQ96MK3 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
FAM20AQ96MK3 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
FAM20AQ96MK3 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
FAM20AQ96MK3 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
FAM20AQ96MK3 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
FAM20AQ96MK3 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
FAM20AQ96MK3 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
FAM20AQ96MK3 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
FAM20AQ96MK3 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
FAM20AQ96MK3 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
FAM20AQ96MK3 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
FAM20AQ96MK3 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
FAM20AQ96MK3 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
FAM20AQ96MK3 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
FAM20AQ96MK3 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
FAM20AQ96MK3 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
FAM20AQ96MK3 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
FAM20AQ96MK3 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
FAM20AQ96MK3 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
FAM20AQ96MK3 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
FAM20AQ96MK3 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
FAM20AQ96MK3 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC24■■□□□ 1.43
FAM20AQ96MK3 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
FAM20AQ96MK3 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
FAM20AQ96MK3 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
FAM20AQ96MK3 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC24■■□□□ 1.43
FAM20AQ96MK3 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
FAM20AQ96MK3 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC24■■□□□ 1.43
FAM20AQ96MK3 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC24■■□□□ 1.43
FAM20AQ96MK3 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
FAM20AQ96MK3 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC24■■□□□ 1.43
FAM20AQ96MK3 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
FAM20AQ96MK3 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
FAM20AQ96MK3 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
FAM20AQ96MK3 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
FAM20AQ96MK3 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
FAM20AQ96MK3 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
FAM20AQ96MK3 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
FAM20AQ96MK3 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
FAM20AQ96MK3 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC23.99■■□□□ 1.43
FAM20AQ96MK3 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
FAM20AQ96MK3 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
FAM20AQ96MK3 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
FAM20AQ96MK3 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
FAM20AQ96MK3 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
FAM20AQ96MK3 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
FAM20AQ96MK3 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
FAM20AQ96MK3 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
FAM20AQ96MK3 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
FAM20AQ96MK3 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
FAM20AQ96MK3 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
FAM20AQ96MK3 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
FAM20AQ96MK3 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
FAM20AQ96MK3 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
FAM20AQ96MK3 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
FAM20AQ96MK3 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
FAM20AQ96MK3 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
FAM20AQ96MK3 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
FAM20AQ96MK3 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
FAM20AQ96MK3 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
FAM20AQ96MK3 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
FAM20AQ96MK3 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
FAM20AQ96MK3 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
FAM20AQ96MK3 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
FAM20AQ96MK3 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
FAM20AQ96MK3 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
FAM20AQ96MK3 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
FAM20AQ96MK3 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
FAM20AQ96MK3 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
FAM20AQ96MK3 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
FAM20AQ96MK3 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
FAM20AQ96MK3 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms