Protein–RNA interactions for Protein: Q96M95

CCDC42, Coiled-coil domain-containing protein 42, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC42Q96M95 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC42Q96M95 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC42Q96M95 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC42Q96M95 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC42Q96M95 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC42Q96M95 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC42Q96M95 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC42Q96M95 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC42Q96M95 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC42Q96M95 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC42Q96M95 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC42Q96M95 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC42Q96M95 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC42Q96M95 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC42Q96M95 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC42Q96M95 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC42Q96M95 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC42Q96M95 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC42Q96M95 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC42Q96M95 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC42Q96M95 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC42Q96M95 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC42Q96M95 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC42Q96M95 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC42Q96M95 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC42Q96M95 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC42Q96M95 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC42Q96M95 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC42Q96M95 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC42Q96M95 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC42Q96M95 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC42Q96M95 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC42Q96M95 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC42Q96M95 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC42Q96M95 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC42Q96M95 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC42Q96M95 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC42Q96M95 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC42Q96M95 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC42Q96M95 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC42Q96M95 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC42Q96M95 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC42Q96M95 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC42Q96M95 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC42Q96M95 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC42Q96M95 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC42Q96M95 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC42Q96M95 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC42Q96M95 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC42Q96M95 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC42Q96M95 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC42Q96M95 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC42Q96M95 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC42Q96M95 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC42Q96M95 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC42Q96M95 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC42Q96M95 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC42Q96M95 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC42Q96M95 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC42Q96M95 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC42Q96M95 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC42Q96M95 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC42Q96M95 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC42Q96M95 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC42Q96M95 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC42Q96M95 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC42Q96M95 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC42Q96M95 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC42Q96M95 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC42Q96M95 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC42Q96M95 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC42Q96M95 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC42Q96M95 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC42Q96M95 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC42Q96M95 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC42Q96M95 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC42Q96M95 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC42Q96M95 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC42Q96M95 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC42Q96M95 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC42Q96M95 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC42Q96M95 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC42Q96M95 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC42Q96M95 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC42Q96M95 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC42Q96M95 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC42Q96M95 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC42Q96M95 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC42Q96M95 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC42Q96M95 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC42Q96M95 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC42Q96M95 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC42Q96M95 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC42Q96M95 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC42Q96M95 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC42Q96M95 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC42Q96M95 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC42Q96M95 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC42Q96M95 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC42Q96M95 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms