Protein–RNA interactions for Protein: Q96LX7

CCDC17, Coiled-coil domain-containing protein 17, humanhuman

Predictions only

Length 622 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC17Q96LX7 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC17Q96LX7 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC17Q96LX7 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC17Q96LX7 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC17Q96LX7 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC17Q96LX7 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC17Q96LX7 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC17Q96LX7 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC17Q96LX7 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC17Q96LX7 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC17Q96LX7 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC17Q96LX7 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC17Q96LX7 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC17Q96LX7 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC17Q96LX7 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC17Q96LX7 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC17Q96LX7 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC17Q96LX7 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC17Q96LX7 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC17Q96LX7 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC17Q96LX7 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC17Q96LX7 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC17Q96LX7 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC17Q96LX7 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC17Q96LX7 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC17Q96LX7 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC17Q96LX7 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC17Q96LX7 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC17Q96LX7 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC17Q96LX7 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC17Q96LX7 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC17Q96LX7 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC17Q96LX7 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC17Q96LX7 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC17Q96LX7 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC17Q96LX7 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC17Q96LX7 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC17Q96LX7 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC17Q96LX7 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC17Q96LX7 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC17Q96LX7 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC17Q96LX7 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC17Q96LX7 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC17Q96LX7 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC17Q96LX7 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC17Q96LX7 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC17Q96LX7 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC17Q96LX7 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC25■■□□□ 1.59
CCDC17Q96LX7 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC17Q96LX7 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC17Q96LX7 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC17Q96LX7 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC17Q96LX7 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC17Q96LX7 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC17Q96LX7 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC17Q96LX7 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC17Q96LX7 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC17Q96LX7 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC17Q96LX7 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC17Q96LX7 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC17Q96LX7 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC17Q96LX7 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC17Q96LX7 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC17Q96LX7 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC17Q96LX7 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC17Q96LX7 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC17Q96LX7 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC17Q96LX7 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC17Q96LX7 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC17Q96LX7 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC17Q96LX7 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC17Q96LX7 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC17Q96LX7 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC17Q96LX7 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC17Q96LX7 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC17Q96LX7 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC17Q96LX7 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC17Q96LX7 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC17Q96LX7 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC17Q96LX7 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC17Q96LX7 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC17Q96LX7 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC17Q96LX7 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC17Q96LX7 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC17Q96LX7 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC17Q96LX7 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC17Q96LX7 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC17Q96LX7 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC17Q96LX7 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC17Q96LX7 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC17Q96LX7 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC17Q96LX7 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC17Q96LX7 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC17Q96LX7 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC17Q96LX7 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC17Q96LX7 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC17Q96LX7 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC17Q96LX7 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC17Q96LX7 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC17Q96LX7 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms