Protein–RNA interactions for Protein: Q96LW4

PRIMPOL, DNA-directed primase/polymerase protein, humanhuman

Predictions only

Length 560 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRIMPOLQ96LW4 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRIMPOLQ96LW4 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRIMPOLQ96LW4 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRIMPOLQ96LW4 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRIMPOLQ96LW4 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRIMPOLQ96LW4 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRIMPOLQ96LW4 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRIMPOLQ96LW4 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRIMPOLQ96LW4 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRIMPOLQ96LW4 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRIMPOLQ96LW4 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
PRIMPOLQ96LW4 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
PRIMPOLQ96LW4 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRIMPOLQ96LW4 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRIMPOLQ96LW4 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRIMPOLQ96LW4 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRIMPOLQ96LW4 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRIMPOLQ96LW4 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRIMPOLQ96LW4 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRIMPOLQ96LW4 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRIMPOLQ96LW4 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRIMPOLQ96LW4 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRIMPOLQ96LW4 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRIMPOLQ96LW4 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRIMPOLQ96LW4 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
PRIMPOLQ96LW4 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
PRIMPOLQ96LW4 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRIMPOLQ96LW4 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRIMPOLQ96LW4 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRIMPOLQ96LW4 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRIMPOLQ96LW4 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRIMPOLQ96LW4 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRIMPOLQ96LW4 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRIMPOLQ96LW4 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRIMPOLQ96LW4 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRIMPOLQ96LW4 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRIMPOLQ96LW4 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRIMPOLQ96LW4 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRIMPOLQ96LW4 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRIMPOLQ96LW4 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRIMPOLQ96LW4 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRIMPOLQ96LW4 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRIMPOLQ96LW4 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRIMPOLQ96LW4 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRIMPOLQ96LW4 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRIMPOLQ96LW4 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRIMPOLQ96LW4 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRIMPOLQ96LW4 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRIMPOLQ96LW4 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRIMPOLQ96LW4 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRIMPOLQ96LW4 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRIMPOLQ96LW4 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRIMPOLQ96LW4 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRIMPOLQ96LW4 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRIMPOLQ96LW4 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRIMPOLQ96LW4 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRIMPOLQ96LW4 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
PRIMPOLQ96LW4 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRIMPOLQ96LW4 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRIMPOLQ96LW4 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRIMPOLQ96LW4 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRIMPOLQ96LW4 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRIMPOLQ96LW4 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRIMPOLQ96LW4 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRIMPOLQ96LW4 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRIMPOLQ96LW4 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRIMPOLQ96LW4 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
PRIMPOLQ96LW4 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PRIMPOLQ96LW4 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PRIMPOLQ96LW4 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PRIMPOLQ96LW4 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PRIMPOLQ96LW4 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PRIMPOLQ96LW4 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PRIMPOLQ96LW4 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PRIMPOLQ96LW4 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
PRIMPOLQ96LW4 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
PRIMPOLQ96LW4 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRIMPOLQ96LW4 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRIMPOLQ96LW4 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
PRIMPOLQ96LW4 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRIMPOLQ96LW4 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRIMPOLQ96LW4 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRIMPOLQ96LW4 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRIMPOLQ96LW4 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
PRIMPOLQ96LW4 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRIMPOLQ96LW4 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRIMPOLQ96LW4 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRIMPOLQ96LW4 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRIMPOLQ96LW4 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRIMPOLQ96LW4 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRIMPOLQ96LW4 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
PRIMPOLQ96LW4 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRIMPOLQ96LW4 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRIMPOLQ96LW4 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRIMPOLQ96LW4 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRIMPOLQ96LW4 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRIMPOLQ96LW4 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRIMPOLQ96LW4 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRIMPOLQ96LW4 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRIMPOLQ96LW4 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms