Protein–RNA interactions for Protein: Q96LL4

C8orf48, Uncharacterized protein C8orf48, humanhuman

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C8orf48Q96LL4 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
C8orf48Q96LL4 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
C8orf48Q96LL4 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
C8orf48Q96LL4 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
C8orf48Q96LL4 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
C8orf48Q96LL4 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
C8orf48Q96LL4 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
C8orf48Q96LL4 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
C8orf48Q96LL4 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
C8orf48Q96LL4 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
C8orf48Q96LL4 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
C8orf48Q96LL4 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
C8orf48Q96LL4 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
C8orf48Q96LL4 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
C8orf48Q96LL4 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
C8orf48Q96LL4 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
C8orf48Q96LL4 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
C8orf48Q96LL4 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
C8orf48Q96LL4 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
C8orf48Q96LL4 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
C8orf48Q96LL4 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
C8orf48Q96LL4 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
C8orf48Q96LL4 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
C8orf48Q96LL4 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
C8orf48Q96LL4 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
C8orf48Q96LL4 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
C8orf48Q96LL4 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
C8orf48Q96LL4 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
C8orf48Q96LL4 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
C8orf48Q96LL4 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
C8orf48Q96LL4 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
C8orf48Q96LL4 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
C8orf48Q96LL4 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
C8orf48Q96LL4 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
C8orf48Q96LL4 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
C8orf48Q96LL4 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
C8orf48Q96LL4 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
C8orf48Q96LL4 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
C8orf48Q96LL4 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
C8orf48Q96LL4 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
C8orf48Q96LL4 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
C8orf48Q96LL4 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
C8orf48Q96LL4 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
C8orf48Q96LL4 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
C8orf48Q96LL4 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
C8orf48Q96LL4 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
C8orf48Q96LL4 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
C8orf48Q96LL4 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
C8orf48Q96LL4 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
C8orf48Q96LL4 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
C8orf48Q96LL4 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
C8orf48Q96LL4 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
C8orf48Q96LL4 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
C8orf48Q96LL4 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
C8orf48Q96LL4 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
C8orf48Q96LL4 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
C8orf48Q96LL4 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
C8orf48Q96LL4 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
C8orf48Q96LL4 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
C8orf48Q96LL4 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
C8orf48Q96LL4 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
C8orf48Q96LL4 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
C8orf48Q96LL4 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
C8orf48Q96LL4 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
C8orf48Q96LL4 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
C8orf48Q96LL4 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
C8orf48Q96LL4 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
C8orf48Q96LL4 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C8orf48Q96LL4 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
C8orf48Q96LL4 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
C8orf48Q96LL4 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C8orf48Q96LL4 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C8orf48Q96LL4 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
C8orf48Q96LL4 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C8orf48Q96LL4 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
C8orf48Q96LL4 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
C8orf48Q96LL4 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
C8orf48Q96LL4 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
C8orf48Q96LL4 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
C8orf48Q96LL4 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
C8orf48Q96LL4 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C8orf48Q96LL4 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
C8orf48Q96LL4 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C8orf48Q96LL4 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
C8orf48Q96LL4 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
C8orf48Q96LL4 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
C8orf48Q96LL4 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
C8orf48Q96LL4 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
C8orf48Q96LL4 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
C8orf48Q96LL4 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
C8orf48Q96LL4 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
C8orf48Q96LL4 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
C8orf48Q96LL4 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
C8orf48Q96LL4 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
C8orf48Q96LL4 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
C8orf48Q96LL4 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
C8orf48Q96LL4 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
C8orf48Q96LL4 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
C8orf48Q96LL4 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
C8orf48Q96LL4 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 130.5 ms