Protein–RNA interactions for Protein: Q96K49

TMEM87B, Transmembrane protein 87B, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM87BQ96K49 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TMEM87BQ96K49 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TMEM87BQ96K49 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TMEM87BQ96K49 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TMEM87BQ96K49 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
TMEM87BQ96K49 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TMEM87BQ96K49 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TMEM87BQ96K49 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TMEM87BQ96K49 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TMEM87BQ96K49 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TMEM87BQ96K49 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TMEM87BQ96K49 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TMEM87BQ96K49 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TMEM87BQ96K49 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TMEM87BQ96K49 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TMEM87BQ96K49 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TMEM87BQ96K49 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
TMEM87BQ96K49 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TMEM87BQ96K49 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TMEM87BQ96K49 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TMEM87BQ96K49 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TMEM87BQ96K49 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TMEM87BQ96K49 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TMEM87BQ96K49 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TMEM87BQ96K49 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TMEM87BQ96K49 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TMEM87BQ96K49 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TMEM87BQ96K49 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TMEM87BQ96K49 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TMEM87BQ96K49 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TMEM87BQ96K49 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TMEM87BQ96K49 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TMEM87BQ96K49 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TMEM87BQ96K49 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TMEM87BQ96K49 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TMEM87BQ96K49 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TMEM87BQ96K49 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TMEM87BQ96K49 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TMEM87BQ96K49 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TMEM87BQ96K49 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TMEM87BQ96K49 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TMEM87BQ96K49 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TMEM87BQ96K49 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TMEM87BQ96K49 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TMEM87BQ96K49 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TMEM87BQ96K49 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TMEM87BQ96K49 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TMEM87BQ96K49 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TMEM87BQ96K49 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TMEM87BQ96K49 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TMEM87BQ96K49 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TMEM87BQ96K49 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TMEM87BQ96K49 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
TMEM87BQ96K49 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TMEM87BQ96K49 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TMEM87BQ96K49 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TMEM87BQ96K49 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TMEM87BQ96K49 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TMEM87BQ96K49 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TMEM87BQ96K49 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TMEM87BQ96K49 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TMEM87BQ96K49 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TMEM87BQ96K49 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TMEM87BQ96K49 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TMEM87BQ96K49 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
TMEM87BQ96K49 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TMEM87BQ96K49 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TMEM87BQ96K49 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
TMEM87BQ96K49 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TMEM87BQ96K49 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
TMEM87BQ96K49 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TMEM87BQ96K49 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TMEM87BQ96K49 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TMEM87BQ96K49 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
TMEM87BQ96K49 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TMEM87BQ96K49 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TMEM87BQ96K49 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
TMEM87BQ96K49 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TMEM87BQ96K49 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC25■■□□□ 1.59
TMEM87BQ96K49 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
TMEM87BQ96K49 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TMEM87BQ96K49 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC25■■□□□ 1.59
TMEM87BQ96K49 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TMEM87BQ96K49 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
TMEM87BQ96K49 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TMEM87BQ96K49 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TMEM87BQ96K49 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TMEM87BQ96K49 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TMEM87BQ96K49 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TMEM87BQ96K49 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TMEM87BQ96K49 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TMEM87BQ96K49 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TMEM87BQ96K49 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TMEM87BQ96K49 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TMEM87BQ96K49 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TMEM87BQ96K49 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TMEM87BQ96K49 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TMEM87BQ96K49 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TMEM87BQ96K49 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TMEM87BQ96K49 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 115.3 ms