Protein–RNA interactions for Protein: Q96JS3

PGBD1, PiggyBac transposable element-derived protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 809 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGBD1Q96JS3 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
PGBD1Q96JS3 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
PGBD1Q96JS3 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
PGBD1Q96JS3 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
PGBD1Q96JS3 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PGBD1Q96JS3 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PGBD1Q96JS3 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PGBD1Q96JS3 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PGBD1Q96JS3 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PGBD1Q96JS3 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PGBD1Q96JS3 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PGBD1Q96JS3 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
PGBD1Q96JS3 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PGBD1Q96JS3 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PGBD1Q96JS3 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PGBD1Q96JS3 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PGBD1Q96JS3 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PGBD1Q96JS3 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PGBD1Q96JS3 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PGBD1Q96JS3 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PGBD1Q96JS3 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PGBD1Q96JS3 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PGBD1Q96JS3 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PGBD1Q96JS3 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PGBD1Q96JS3 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PGBD1Q96JS3 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PGBD1Q96JS3 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PGBD1Q96JS3 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PGBD1Q96JS3 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PGBD1Q96JS3 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PGBD1Q96JS3 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PGBD1Q96JS3 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PGBD1Q96JS3 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
PGBD1Q96JS3 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PGBD1Q96JS3 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
PGBD1Q96JS3 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PGBD1Q96JS3 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PGBD1Q96JS3 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PGBD1Q96JS3 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PGBD1Q96JS3 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PGBD1Q96JS3 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PGBD1Q96JS3 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PGBD1Q96JS3 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
PGBD1Q96JS3 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PGBD1Q96JS3 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PGBD1Q96JS3 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PGBD1Q96JS3 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PGBD1Q96JS3 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PGBD1Q96JS3 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PGBD1Q96JS3 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PGBD1Q96JS3 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PGBD1Q96JS3 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PGBD1Q96JS3 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PGBD1Q96JS3 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PGBD1Q96JS3 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
PGBD1Q96JS3 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PGBD1Q96JS3 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PGBD1Q96JS3 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
PGBD1Q96JS3 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
PGBD1Q96JS3 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PGBD1Q96JS3 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PGBD1Q96JS3 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PGBD1Q96JS3 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PGBD1Q96JS3 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PGBD1Q96JS3 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PGBD1Q96JS3 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PGBD1Q96JS3 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PGBD1Q96JS3 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PGBD1Q96JS3 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PGBD1Q96JS3 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PGBD1Q96JS3 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PGBD1Q96JS3 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
PGBD1Q96JS3 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PGBD1Q96JS3 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PGBD1Q96JS3 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PGBD1Q96JS3 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PGBD1Q96JS3 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PGBD1Q96JS3 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PGBD1Q96JS3 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PGBD1Q96JS3 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PGBD1Q96JS3 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PGBD1Q96JS3 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PGBD1Q96JS3 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PGBD1Q96JS3 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PGBD1Q96JS3 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PGBD1Q96JS3 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PGBD1Q96JS3 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
PGBD1Q96JS3 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PGBD1Q96JS3 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
PGBD1Q96JS3 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PGBD1Q96JS3 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PGBD1Q96JS3 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PGBD1Q96JS3 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PGBD1Q96JS3 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PGBD1Q96JS3 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PGBD1Q96JS3 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
PGBD1Q96JS3 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PGBD1Q96JS3 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PGBD1Q96JS3 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PGBD1Q96JS3 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms