Protein–RNA interactions for Protein: Q96JN2

CCDC136, Coiled-coil domain-containing protein 136, humanhuman

Predictions only

Length 1,154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC136Q96JN2 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CCDC136Q96JN2 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CCDC136Q96JN2 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CCDC136Q96JN2 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CCDC136Q96JN2 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CCDC136Q96JN2 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CCDC136Q96JN2 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CCDC136Q96JN2 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CCDC136Q96JN2 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CCDC136Q96JN2 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CCDC136Q96JN2 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CCDC136Q96JN2 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CCDC136Q96JN2 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CCDC136Q96JN2 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CCDC136Q96JN2 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CCDC136Q96JN2 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CCDC136Q96JN2 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CCDC136Q96JN2 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CCDC136Q96JN2 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CCDC136Q96JN2 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CCDC136Q96JN2 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CCDC136Q96JN2 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CCDC136Q96JN2 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CCDC136Q96JN2 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CCDC136Q96JN2 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CCDC136Q96JN2 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CCDC136Q96JN2 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CCDC136Q96JN2 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CCDC136Q96JN2 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CCDC136Q96JN2 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CCDC136Q96JN2 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CCDC136Q96JN2 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CCDC136Q96JN2 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CCDC136Q96JN2 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CCDC136Q96JN2 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CCDC136Q96JN2 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CCDC136Q96JN2 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CCDC136Q96JN2 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
CCDC136Q96JN2 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CCDC136Q96JN2 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CCDC136Q96JN2 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CCDC136Q96JN2 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CCDC136Q96JN2 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CCDC136Q96JN2 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CCDC136Q96JN2 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CCDC136Q96JN2 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CCDC136Q96JN2 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
CCDC136Q96JN2 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CCDC136Q96JN2 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CCDC136Q96JN2 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CCDC136Q96JN2 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CCDC136Q96JN2 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CCDC136Q96JN2 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CCDC136Q96JN2 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
CCDC136Q96JN2 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CCDC136Q96JN2 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CCDC136Q96JN2 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CCDC136Q96JN2 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CCDC136Q96JN2 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CCDC136Q96JN2 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CCDC136Q96JN2 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CCDC136Q96JN2 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CCDC136Q96JN2 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CCDC136Q96JN2 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CCDC136Q96JN2 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CCDC136Q96JN2 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CCDC136Q96JN2 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CCDC136Q96JN2 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CCDC136Q96JN2 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CCDC136Q96JN2 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
CCDC136Q96JN2 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CCDC136Q96JN2 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CCDC136Q96JN2 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CCDC136Q96JN2 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CCDC136Q96JN2 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
CCDC136Q96JN2 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
CCDC136Q96JN2 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CCDC136Q96JN2 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CCDC136Q96JN2 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CCDC136Q96JN2 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CCDC136Q96JN2 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CCDC136Q96JN2 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CCDC136Q96JN2 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CCDC136Q96JN2 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CCDC136Q96JN2 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CCDC136Q96JN2 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CCDC136Q96JN2 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CCDC136Q96JN2 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CCDC136Q96JN2 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CCDC136Q96JN2 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CCDC136Q96JN2 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CCDC136Q96JN2 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CCDC136Q96JN2 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CCDC136Q96JN2 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CCDC136Q96JN2 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CCDC136Q96JN2 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CCDC136Q96JN2 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CCDC136Q96JN2 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CCDC136Q96JN2 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CCDC136Q96JN2 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms