Protein–RNA interactions for Protein: Q96IS3

RAX2, Retina and anterior neural fold homeobox protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAX2Q96IS3 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAX2Q96IS3 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAX2Q96IS3 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAX2Q96IS3 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAX2Q96IS3 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAX2Q96IS3 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAX2Q96IS3 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAX2Q96IS3 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAX2Q96IS3 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAX2Q96IS3 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAX2Q96IS3 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
RAX2Q96IS3 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAX2Q96IS3 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAX2Q96IS3 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAX2Q96IS3 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAX2Q96IS3 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAX2Q96IS3 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
RAX2Q96IS3 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAX2Q96IS3 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAX2Q96IS3 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAX2Q96IS3 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAX2Q96IS3 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAX2Q96IS3 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAX2Q96IS3 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAX2Q96IS3 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAX2Q96IS3 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAX2Q96IS3 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAX2Q96IS3 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAX2Q96IS3 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAX2Q96IS3 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAX2Q96IS3 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAX2Q96IS3 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAX2Q96IS3 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAX2Q96IS3 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAX2Q96IS3 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAX2Q96IS3 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAX2Q96IS3 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAX2Q96IS3 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAX2Q96IS3 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAX2Q96IS3 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAX2Q96IS3 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAX2Q96IS3 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
RAX2Q96IS3 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAX2Q96IS3 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAX2Q96IS3 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAX2Q96IS3 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAX2Q96IS3 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAX2Q96IS3 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAX2Q96IS3 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAX2Q96IS3 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAX2Q96IS3 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAX2Q96IS3 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAX2Q96IS3 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAX2Q96IS3 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAX2Q96IS3 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAX2Q96IS3 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAX2Q96IS3 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAX2Q96IS3 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAX2Q96IS3 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAX2Q96IS3 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
RAX2Q96IS3 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
RAX2Q96IS3 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAX2Q96IS3 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAX2Q96IS3 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAX2Q96IS3 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
RAX2Q96IS3 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAX2Q96IS3 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAX2Q96IS3 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAX2Q96IS3 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAX2Q96IS3 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAX2Q96IS3 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAX2Q96IS3 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAX2Q96IS3 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAX2Q96IS3 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAX2Q96IS3 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAX2Q96IS3 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAX2Q96IS3 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAX2Q96IS3 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAX2Q96IS3 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAX2Q96IS3 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAX2Q96IS3 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAX2Q96IS3 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAX2Q96IS3 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAX2Q96IS3 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAX2Q96IS3 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAX2Q96IS3 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAX2Q96IS3 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAX2Q96IS3 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAX2Q96IS3 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAX2Q96IS3 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAX2Q96IS3 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAX2Q96IS3 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAX2Q96IS3 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAX2Q96IS3 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAX2Q96IS3 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAX2Q96IS3 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAX2Q96IS3 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAX2Q96IS3 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAX2Q96IS3 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
RAX2Q96IS3 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 113.1 ms