Protein–RNA interactions for Protein: Q96GN5

CDCA7L, Cell division cycle-associated 7-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDCA7LQ96GN5 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CDCA7LQ96GN5 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CDCA7LQ96GN5 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CDCA7LQ96GN5 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CDCA7LQ96GN5 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CDCA7LQ96GN5 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CDCA7LQ96GN5 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CDCA7LQ96GN5 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CDCA7LQ96GN5 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CDCA7LQ96GN5 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CDCA7LQ96GN5 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CDCA7LQ96GN5 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
CDCA7LQ96GN5 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
CDCA7LQ96GN5 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CDCA7LQ96GN5 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CDCA7LQ96GN5 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CDCA7LQ96GN5 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CDCA7LQ96GN5 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CDCA7LQ96GN5 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CDCA7LQ96GN5 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CDCA7LQ96GN5 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CDCA7LQ96GN5 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CDCA7LQ96GN5 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CDCA7LQ96GN5 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
CDCA7LQ96GN5 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
CDCA7LQ96GN5 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
CDCA7LQ96GN5 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
CDCA7LQ96GN5 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CDCA7LQ96GN5 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CDCA7LQ96GN5 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CDCA7LQ96GN5 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CDCA7LQ96GN5 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CDCA7LQ96GN5 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CDCA7LQ96GN5 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CDCA7LQ96GN5 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
CDCA7LQ96GN5 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CDCA7LQ96GN5 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CDCA7LQ96GN5 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CDCA7LQ96GN5 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CDCA7LQ96GN5 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CDCA7LQ96GN5 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CDCA7LQ96GN5 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CDCA7LQ96GN5 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CDCA7LQ96GN5 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CDCA7LQ96GN5 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CDCA7LQ96GN5 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CDCA7LQ96GN5 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CDCA7LQ96GN5 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
CDCA7LQ96GN5 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CDCA7LQ96GN5 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CDCA7LQ96GN5 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CDCA7LQ96GN5 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CDCA7LQ96GN5 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CDCA7LQ96GN5 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CDCA7LQ96GN5 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
CDCA7LQ96GN5 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CDCA7LQ96GN5 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CDCA7LQ96GN5 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CDCA7LQ96GN5 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
CDCA7LQ96GN5 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CDCA7LQ96GN5 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CDCA7LQ96GN5 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CDCA7LQ96GN5 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CDCA7LQ96GN5 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CDCA7LQ96GN5 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CDCA7LQ96GN5 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CDCA7LQ96GN5 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CDCA7LQ96GN5 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CDCA7LQ96GN5 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CDCA7LQ96GN5 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CDCA7LQ96GN5 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CDCA7LQ96GN5 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CDCA7LQ96GN5 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CDCA7LQ96GN5 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CDCA7LQ96GN5 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CDCA7LQ96GN5 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CDCA7LQ96GN5 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CDCA7LQ96GN5 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CDCA7LQ96GN5 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CDCA7LQ96GN5 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CDCA7LQ96GN5 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CDCA7LQ96GN5 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
CDCA7LQ96GN5 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CDCA7LQ96GN5 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CDCA7LQ96GN5 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CDCA7LQ96GN5 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CDCA7LQ96GN5 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CDCA7LQ96GN5 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CDCA7LQ96GN5 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
CDCA7LQ96GN5 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CDCA7LQ96GN5 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CDCA7LQ96GN5 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CDCA7LQ96GN5 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CDCA7LQ96GN5 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CDCA7LQ96GN5 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
CDCA7LQ96GN5 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CDCA7LQ96GN5 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CDCA7LQ96GN5 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CDCA7LQ96GN5 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
CDCA7LQ96GN5 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms