Protein–RNA interactions for Protein: Q96GJ1

TRMT2B, tRNA (uracil(54)-C(5))-methyltransferase homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 504 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRMT2BQ96GJ1 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRMT2BQ96GJ1 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRMT2BQ96GJ1 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRMT2BQ96GJ1 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRMT2BQ96GJ1 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRMT2BQ96GJ1 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRMT2BQ96GJ1 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRMT2BQ96GJ1 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
TRMT2BQ96GJ1 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRMT2BQ96GJ1 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
TRMT2BQ96GJ1 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRMT2BQ96GJ1 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRMT2BQ96GJ1 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRMT2BQ96GJ1 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRMT2BQ96GJ1 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRMT2BQ96GJ1 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRMT2BQ96GJ1 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRMT2BQ96GJ1 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRMT2BQ96GJ1 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
TRMT2BQ96GJ1 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRMT2BQ96GJ1 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRMT2BQ96GJ1 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRMT2BQ96GJ1 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRMT2BQ96GJ1 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRMT2BQ96GJ1 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRMT2BQ96GJ1 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRMT2BQ96GJ1 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRMT2BQ96GJ1 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRMT2BQ96GJ1 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRMT2BQ96GJ1 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRMT2BQ96GJ1 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRMT2BQ96GJ1 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRMT2BQ96GJ1 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRMT2BQ96GJ1 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
TRMT2BQ96GJ1 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRMT2BQ96GJ1 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRMT2BQ96GJ1 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRMT2BQ96GJ1 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRMT2BQ96GJ1 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRMT2BQ96GJ1 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRMT2BQ96GJ1 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRMT2BQ96GJ1 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRMT2BQ96GJ1 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRMT2BQ96GJ1 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRMT2BQ96GJ1 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRMT2BQ96GJ1 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRMT2BQ96GJ1 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRMT2BQ96GJ1 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRMT2BQ96GJ1 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRMT2BQ96GJ1 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRMT2BQ96GJ1 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRMT2BQ96GJ1 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRMT2BQ96GJ1 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRMT2BQ96GJ1 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRMT2BQ96GJ1 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRMT2BQ96GJ1 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRMT2BQ96GJ1 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRMT2BQ96GJ1 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
TRMT2BQ96GJ1 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRMT2BQ96GJ1 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
TRMT2BQ96GJ1 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRMT2BQ96GJ1 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRMT2BQ96GJ1 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRMT2BQ96GJ1 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRMT2BQ96GJ1 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRMT2BQ96GJ1 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRMT2BQ96GJ1 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRMT2BQ96GJ1 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRMT2BQ96GJ1 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRMT2BQ96GJ1 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRMT2BQ96GJ1 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRMT2BQ96GJ1 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRMT2BQ96GJ1 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRMT2BQ96GJ1 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRMT2BQ96GJ1 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRMT2BQ96GJ1 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRMT2BQ96GJ1 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRMT2BQ96GJ1 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRMT2BQ96GJ1 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
TRMT2BQ96GJ1 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRMT2BQ96GJ1 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
TRMT2BQ96GJ1 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
TRMT2BQ96GJ1 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
TRMT2BQ96GJ1 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRMT2BQ96GJ1 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRMT2BQ96GJ1 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRMT2BQ96GJ1 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
TRMT2BQ96GJ1 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
TRMT2BQ96GJ1 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRMT2BQ96GJ1 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRMT2BQ96GJ1 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRMT2BQ96GJ1 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRMT2BQ96GJ1 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
TRMT2BQ96GJ1 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRMT2BQ96GJ1 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
TRMT2BQ96GJ1 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
TRMT2BQ96GJ1 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRMT2BQ96GJ1 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRMT2BQ96GJ1 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRMT2BQ96GJ1 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms