Protein–RNA interactions for Protein: Q96GA3

LTV1, Protein LTV1 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 475 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTV1Q96GA3 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
LTV1Q96GA3 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
LTV1Q96GA3 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
LTV1Q96GA3 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
LTV1Q96GA3 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
LTV1Q96GA3 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
LTV1Q96GA3 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC28.51■■■□□ 2.15
LTV1Q96GA3 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
LTV1Q96GA3 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
LTV1Q96GA3 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
LTV1Q96GA3 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC28.5■■■□□ 2.15
LTV1Q96GA3 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
LTV1Q96GA3 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
LTV1Q96GA3 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
LTV1Q96GA3 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
LTV1Q96GA3 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
LTV1Q96GA3 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
LTV1Q96GA3 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
LTV1Q96GA3 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
LTV1Q96GA3 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC28.49■■■□□ 2.15
LTV1Q96GA3 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
LTV1Q96GA3 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
LTV1Q96GA3 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
LTV1Q96GA3 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
LTV1Q96GA3 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
LTV1Q96GA3 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
LTV1Q96GA3 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
LTV1Q96GA3 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
LTV1Q96GA3 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
LTV1Q96GA3 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
LTV1Q96GA3 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
LTV1Q96GA3 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC28.48■■■□□ 2.15
LTV1Q96GA3 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
LTV1Q96GA3 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
LTV1Q96GA3 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
LTV1Q96GA3 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC28.48■■■□□ 2.15
LTV1Q96GA3 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
LTV1Q96GA3 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
LTV1Q96GA3 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
LTV1Q96GA3 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
LTV1Q96GA3 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
LTV1Q96GA3 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
LTV1Q96GA3 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
LTV1Q96GA3 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
LTV1Q96GA3 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
LTV1Q96GA3 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
LTV1Q96GA3 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
LTV1Q96GA3 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
LTV1Q96GA3 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
LTV1Q96GA3 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
LTV1Q96GA3 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
LTV1Q96GA3 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
LTV1Q96GA3 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
LTV1Q96GA3 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
LTV1Q96GA3 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
LTV1Q96GA3 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
LTV1Q96GA3 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
LTV1Q96GA3 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
LTV1Q96GA3 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
LTV1Q96GA3 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.15
LTV1Q96GA3 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
LTV1Q96GA3 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
LTV1Q96GA3 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
LTV1Q96GA3 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
LTV1Q96GA3 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
LTV1Q96GA3 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
LTV1Q96GA3 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
LTV1Q96GA3 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
LTV1Q96GA3 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
LTV1Q96GA3 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
LTV1Q96GA3 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
LTV1Q96GA3 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
LTV1Q96GA3 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
LTV1Q96GA3 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
LTV1Q96GA3 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
LTV1Q96GA3 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
LTV1Q96GA3 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
LTV1Q96GA3 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
LTV1Q96GA3 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
LTV1Q96GA3 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
LTV1Q96GA3 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
LTV1Q96GA3 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
LTV1Q96GA3 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
LTV1Q96GA3 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
LTV1Q96GA3 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
LTV1Q96GA3 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
LTV1Q96GA3 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
LTV1Q96GA3 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
LTV1Q96GA3 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
LTV1Q96GA3 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
LTV1Q96GA3 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
LTV1Q96GA3 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
LTV1Q96GA3 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
LTV1Q96GA3 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
LTV1Q96GA3 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
LTV1Q96GA3 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
LTV1Q96GA3 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
LTV1Q96GA3 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
LTV1Q96GA3 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
LTV1Q96GA3 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms