Protein–RNA interactions for Protein: Q96F63

CCDC97, Coiled-coil domain-containing protein 97, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC97Q96F63 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC97Q96F63 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC97Q96F63 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC97Q96F63 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC97Q96F63 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC97Q96F63 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC97Q96F63 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC97Q96F63 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC97Q96F63 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC97Q96F63 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC97Q96F63 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC97Q96F63 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC97Q96F63 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC97Q96F63 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC97Q96F63 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC97Q96F63 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC97Q96F63 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC97Q96F63 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC97Q96F63 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC97Q96F63 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC97Q96F63 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC97Q96F63 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC97Q96F63 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC97Q96F63 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC97Q96F63 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC97Q96F63 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC97Q96F63 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC97Q96F63 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC97Q96F63 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC97Q96F63 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC97Q96F63 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC97Q96F63 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC97Q96F63 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC97Q96F63 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC97Q96F63 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC97Q96F63 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC97Q96F63 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC97Q96F63 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC97Q96F63 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC97Q96F63 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC97Q96F63 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC97Q96F63 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC97Q96F63 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC97Q96F63 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC97Q96F63 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC97Q96F63 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC97Q96F63 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC97Q96F63 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC97Q96F63 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC97Q96F63 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC97Q96F63 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC97Q96F63 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC97Q96F63 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC97Q96F63 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC97Q96F63 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC97Q96F63 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC97Q96F63 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC97Q96F63 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC97Q96F63 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC97Q96F63 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC97Q96F63 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC97Q96F63 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC97Q96F63 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC97Q96F63 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC97Q96F63 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC97Q96F63 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC97Q96F63 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC97Q96F63 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC97Q96F63 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC97Q96F63 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
CCDC97Q96F63 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CCDC97Q96F63 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CCDC97Q96F63 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CCDC97Q96F63 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC97Q96F63 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC97Q96F63 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC97Q96F63 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC97Q96F63 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC97Q96F63 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC97Q96F63 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC97Q96F63 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC97Q96F63 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC97Q96F63 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC97Q96F63 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC97Q96F63 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC97Q96F63 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC97Q96F63 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC97Q96F63 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC97Q96F63 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC97Q96F63 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC97Q96F63 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC97Q96F63 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC97Q96F63 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC97Q96F63 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC97Q96F63 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC97Q96F63 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC97Q96F63 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC97Q96F63 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC97Q96F63 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC97Q96F63 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms