Protein–RNA interactions for Protein: Q96EU6

RRP36, Ribosomal RNA processing protein 36 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 259 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRP36Q96EU6 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RRP36Q96EU6 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RRP36Q96EU6 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RRP36Q96EU6 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RRP36Q96EU6 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
RRP36Q96EU6 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
RRP36Q96EU6 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RRP36Q96EU6 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RRP36Q96EU6 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
RRP36Q96EU6 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RRP36Q96EU6 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RRP36Q96EU6 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
RRP36Q96EU6 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RRP36Q96EU6 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RRP36Q96EU6 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RRP36Q96EU6 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RRP36Q96EU6 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RRP36Q96EU6 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RRP36Q96EU6 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RRP36Q96EU6 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RRP36Q96EU6 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RRP36Q96EU6 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RRP36Q96EU6 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RRP36Q96EU6 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RRP36Q96EU6 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RRP36Q96EU6 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RRP36Q96EU6 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RRP36Q96EU6 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RRP36Q96EU6 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RRP36Q96EU6 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RRP36Q96EU6 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RRP36Q96EU6 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RRP36Q96EU6 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RRP36Q96EU6 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RRP36Q96EU6 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RRP36Q96EU6 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RRP36Q96EU6 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RRP36Q96EU6 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RRP36Q96EU6 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RRP36Q96EU6 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RRP36Q96EU6 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RRP36Q96EU6 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RRP36Q96EU6 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RRP36Q96EU6 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
RRP36Q96EU6 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RRP36Q96EU6 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RRP36Q96EU6 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RRP36Q96EU6 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RRP36Q96EU6 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RRP36Q96EU6 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RRP36Q96EU6 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RRP36Q96EU6 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RRP36Q96EU6 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RRP36Q96EU6 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RRP36Q96EU6 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RRP36Q96EU6 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RRP36Q96EU6 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RRP36Q96EU6 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RRP36Q96EU6 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RRP36Q96EU6 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RRP36Q96EU6 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RRP36Q96EU6 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RRP36Q96EU6 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RRP36Q96EU6 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RRP36Q96EU6 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
RRP36Q96EU6 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RRP36Q96EU6 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RRP36Q96EU6 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RRP36Q96EU6 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RRP36Q96EU6 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RRP36Q96EU6 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RRP36Q96EU6 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
RRP36Q96EU6 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RRP36Q96EU6 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
RRP36Q96EU6 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
RRP36Q96EU6 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
RRP36Q96EU6 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
RRP36Q96EU6 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
RRP36Q96EU6 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
RRP36Q96EU6 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
RRP36Q96EU6 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RRP36Q96EU6 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RRP36Q96EU6 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RRP36Q96EU6 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RRP36Q96EU6 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RRP36Q96EU6 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RRP36Q96EU6 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RRP36Q96EU6 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RRP36Q96EU6 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RRP36Q96EU6 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RRP36Q96EU6 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RRP36Q96EU6 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RRP36Q96EU6 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RRP36Q96EU6 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RRP36Q96EU6 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
RRP36Q96EU6 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RRP36Q96EU6 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
RRP36Q96EU6 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RRP36Q96EU6 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RRP36Q96EU6 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms