Protein–RNA interactions for Protein: Q96ES6

MFSD3, Major facilitator superfamily domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MFSD3Q96ES6 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MFSD3Q96ES6 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MFSD3Q96ES6 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MFSD3Q96ES6 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
MFSD3Q96ES6 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
MFSD3Q96ES6 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MFSD3Q96ES6 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
MFSD3Q96ES6 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MFSD3Q96ES6 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MFSD3Q96ES6 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MFSD3Q96ES6 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MFSD3Q96ES6 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MFSD3Q96ES6 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MFSD3Q96ES6 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MFSD3Q96ES6 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MFSD3Q96ES6 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MFSD3Q96ES6 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MFSD3Q96ES6 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MFSD3Q96ES6 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MFSD3Q96ES6 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MFSD3Q96ES6 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MFSD3Q96ES6 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MFSD3Q96ES6 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MFSD3Q96ES6 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MFSD3Q96ES6 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MFSD3Q96ES6 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MFSD3Q96ES6 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MFSD3Q96ES6 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MFSD3Q96ES6 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MFSD3Q96ES6 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MFSD3Q96ES6 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
MFSD3Q96ES6 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
MFSD3Q96ES6 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
MFSD3Q96ES6 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MFSD3Q96ES6 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MFSD3Q96ES6 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MFSD3Q96ES6 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MFSD3Q96ES6 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MFSD3Q96ES6 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MFSD3Q96ES6 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MFSD3Q96ES6 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MFSD3Q96ES6 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MFSD3Q96ES6 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MFSD3Q96ES6 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MFSD3Q96ES6 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MFSD3Q96ES6 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MFSD3Q96ES6 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MFSD3Q96ES6 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MFSD3Q96ES6 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
MFSD3Q96ES6 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MFSD3Q96ES6 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MFSD3Q96ES6 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MFSD3Q96ES6 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MFSD3Q96ES6 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MFSD3Q96ES6 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MFSD3Q96ES6 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
MFSD3Q96ES6 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MFSD3Q96ES6 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MFSD3Q96ES6 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MFSD3Q96ES6 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MFSD3Q96ES6 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MFSD3Q96ES6 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MFSD3Q96ES6 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MFSD3Q96ES6 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MFSD3Q96ES6 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MFSD3Q96ES6 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MFSD3Q96ES6 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MFSD3Q96ES6 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MFSD3Q96ES6 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MFSD3Q96ES6 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MFSD3Q96ES6 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MFSD3Q96ES6 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MFSD3Q96ES6 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MFSD3Q96ES6 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MFSD3Q96ES6 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MFSD3Q96ES6 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MFSD3Q96ES6 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MFSD3Q96ES6 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
MFSD3Q96ES6 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MFSD3Q96ES6 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
MFSD3Q96ES6 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MFSD3Q96ES6 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MFSD3Q96ES6 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MFSD3Q96ES6 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MFSD3Q96ES6 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MFSD3Q96ES6 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MFSD3Q96ES6 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MFSD3Q96ES6 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MFSD3Q96ES6 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MFSD3Q96ES6 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MFSD3Q96ES6 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MFSD3Q96ES6 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MFSD3Q96ES6 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MFSD3Q96ES6 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MFSD3Q96ES6 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MFSD3Q96ES6 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MFSD3Q96ES6 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MFSD3Q96ES6 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MFSD3Q96ES6 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MFSD3Q96ES6 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms