Protein–RNA interactions for Protein: Q96EH8

NEURL3, E3 ubiquitin-protein ligase NEURL3, humanhuman

Predictions only

Length 262 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEURL3Q96EH8 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NEURL3Q96EH8 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
NEURL3Q96EH8 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NEURL3Q96EH8 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NEURL3Q96EH8 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
NEURL3Q96EH8 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NEURL3Q96EH8 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
NEURL3Q96EH8 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
NEURL3Q96EH8 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
NEURL3Q96EH8 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
NEURL3Q96EH8 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NEURL3Q96EH8 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NEURL3Q96EH8 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NEURL3Q96EH8 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
NEURL3Q96EH8 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NEURL3Q96EH8 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
NEURL3Q96EH8 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NEURL3Q96EH8 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
NEURL3Q96EH8 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
NEURL3Q96EH8 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NEURL3Q96EH8 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
NEURL3Q96EH8 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NEURL3Q96EH8 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NEURL3Q96EH8 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
NEURL3Q96EH8 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NEURL3Q96EH8 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NEURL3Q96EH8 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
NEURL3Q96EH8 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
NEURL3Q96EH8 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
NEURL3Q96EH8 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NEURL3Q96EH8 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NEURL3Q96EH8 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NEURL3Q96EH8 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NEURL3Q96EH8 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
NEURL3Q96EH8 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC19.92■□□□□ 0.78
NEURL3Q96EH8 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
NEURL3Q96EH8 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NEURL3Q96EH8 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NEURL3Q96EH8 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
NEURL3Q96EH8 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NEURL3Q96EH8 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NEURL3Q96EH8 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NEURL3Q96EH8 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NEURL3Q96EH8 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
NEURL3Q96EH8 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
NEURL3Q96EH8 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NEURL3Q96EH8 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
NEURL3Q96EH8 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
NEURL3Q96EH8 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
NEURL3Q96EH8 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
NEURL3Q96EH8 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
NEURL3Q96EH8 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NEURL3Q96EH8 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NEURL3Q96EH8 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NEURL3Q96EH8 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NEURL3Q96EH8 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
NEURL3Q96EH8 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NEURL3Q96EH8 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NEURL3Q96EH8 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NEURL3Q96EH8 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
NEURL3Q96EH8 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NEURL3Q96EH8 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NEURL3Q96EH8 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NEURL3Q96EH8 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NEURL3Q96EH8 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NEURL3Q96EH8 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NEURL3Q96EH8 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NEURL3Q96EH8 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NEURL3Q96EH8 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NEURL3Q96EH8 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
NEURL3Q96EH8 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NEURL3Q96EH8 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NEURL3Q96EH8 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NEURL3Q96EH8 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NEURL3Q96EH8 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
NEURL3Q96EH8 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
NEURL3Q96EH8 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.78
NEURL3Q96EH8 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
NEURL3Q96EH8 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
NEURL3Q96EH8 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
NEURL3Q96EH8 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
NEURL3Q96EH8 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
NEURL3Q96EH8 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
NEURL3Q96EH8 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
NEURL3Q96EH8 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
NEURL3Q96EH8 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
NEURL3Q96EH8 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
NEURL3Q96EH8 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
NEURL3Q96EH8 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
NEURL3Q96EH8 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
NEURL3Q96EH8 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
NEURL3Q96EH8 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
NEURL3Q96EH8 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
NEURL3Q96EH8 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
NEURL3Q96EH8 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
NEURL3Q96EH8 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.88■□□□□ 0.77
NEURL3Q96EH8 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
NEURL3Q96EH8 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
NEURL3Q96EH8 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
NEURL3Q96EH8 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms