Protein–RNA interactions for Protein: Q96DD0

LRRC39, Leucine-rich repeat-containing protein 39, humanhuman

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Length 335 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC39Q96DD0 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LRRC39Q96DD0 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LRRC39Q96DD0 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LRRC39Q96DD0 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LRRC39Q96DD0 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LRRC39Q96DD0 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
LRRC39Q96DD0 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LRRC39Q96DD0 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LRRC39Q96DD0 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LRRC39Q96DD0 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LRRC39Q96DD0 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
LRRC39Q96DD0 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LRRC39Q96DD0 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
LRRC39Q96DD0 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LRRC39Q96DD0 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
LRRC39Q96DD0 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LRRC39Q96DD0 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
LRRC39Q96DD0 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LRRC39Q96DD0 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LRRC39Q96DD0 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LRRC39Q96DD0 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LRRC39Q96DD0 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
LRRC39Q96DD0 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LRRC39Q96DD0 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
LRRC39Q96DD0 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
LRRC39Q96DD0 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
LRRC39Q96DD0 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LRRC39Q96DD0 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LRRC39Q96DD0 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LRRC39Q96DD0 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LRRC39Q96DD0 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LRRC39Q96DD0 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LRRC39Q96DD0 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LRRC39Q96DD0 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LRRC39Q96DD0 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LRRC39Q96DD0 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LRRC39Q96DD0 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LRRC39Q96DD0 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LRRC39Q96DD0 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LRRC39Q96DD0 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LRRC39Q96DD0 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LRRC39Q96DD0 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LRRC39Q96DD0 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LRRC39Q96DD0 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LRRC39Q96DD0 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LRRC39Q96DD0 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LRRC39Q96DD0 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LRRC39Q96DD0 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LRRC39Q96DD0 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LRRC39Q96DD0 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LRRC39Q96DD0 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LRRC39Q96DD0 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LRRC39Q96DD0 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LRRC39Q96DD0 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LRRC39Q96DD0 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LRRC39Q96DD0 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LRRC39Q96DD0 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LRRC39Q96DD0 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LRRC39Q96DD0 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LRRC39Q96DD0 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LRRC39Q96DD0 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LRRC39Q96DD0 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LRRC39Q96DD0 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LRRC39Q96DD0 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LRRC39Q96DD0 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LRRC39Q96DD0 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LRRC39Q96DD0 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LRRC39Q96DD0 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LRRC39Q96DD0 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LRRC39Q96DD0 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LRRC39Q96DD0 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LRRC39Q96DD0 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LRRC39Q96DD0 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LRRC39Q96DD0 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LRRC39Q96DD0 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LRRC39Q96DD0 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LRRC39Q96DD0 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LRRC39Q96DD0 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LRRC39Q96DD0 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LRRC39Q96DD0 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
LRRC39Q96DD0 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LRRC39Q96DD0 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LRRC39Q96DD0 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LRRC39Q96DD0 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LRRC39Q96DD0 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
LRRC39Q96DD0 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LRRC39Q96DD0 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LRRC39Q96DD0 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LRRC39Q96DD0 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LRRC39Q96DD0 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LRRC39Q96DD0 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LRRC39Q96DD0 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LRRC39Q96DD0 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LRRC39Q96DD0 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LRRC39Q96DD0 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LRRC39Q96DD0 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LRRC39Q96DD0 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LRRC39Q96DD0 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LRRC39Q96DD0 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LRRC39Q96DD0 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
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