Protein–RNA interactions for Protein: Q96DB5

RMDN1, Regulator of microtubule dynamics protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RMDN1Q96DB5 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RMDN1Q96DB5 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
RMDN1Q96DB5 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RMDN1Q96DB5 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RMDN1Q96DB5 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RMDN1Q96DB5 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
RMDN1Q96DB5 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RMDN1Q96DB5 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RMDN1Q96DB5 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RMDN1Q96DB5 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RMDN1Q96DB5 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RMDN1Q96DB5 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RMDN1Q96DB5 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RMDN1Q96DB5 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RMDN1Q96DB5 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RMDN1Q96DB5 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RMDN1Q96DB5 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
RMDN1Q96DB5 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RMDN1Q96DB5 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
RMDN1Q96DB5 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
RMDN1Q96DB5 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
RMDN1Q96DB5 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC22■■□□□ 1.11
RMDN1Q96DB5 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
RMDN1Q96DB5 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RMDN1Q96DB5 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RMDN1Q96DB5 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RMDN1Q96DB5 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
RMDN1Q96DB5 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RMDN1Q96DB5 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RMDN1Q96DB5 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RMDN1Q96DB5 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RMDN1Q96DB5 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RMDN1Q96DB5 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
RMDN1Q96DB5 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RMDN1Q96DB5 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RMDN1Q96DB5 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RMDN1Q96DB5 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RMDN1Q96DB5 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RMDN1Q96DB5 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RMDN1Q96DB5 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RMDN1Q96DB5 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RMDN1Q96DB5 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RMDN1Q96DB5 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RMDN1Q96DB5 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RMDN1Q96DB5 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RMDN1Q96DB5 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RMDN1Q96DB5 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RMDN1Q96DB5 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RMDN1Q96DB5 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RMDN1Q96DB5 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RMDN1Q96DB5 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RMDN1Q96DB5 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RMDN1Q96DB5 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
RMDN1Q96DB5 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RMDN1Q96DB5 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RMDN1Q96DB5 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RMDN1Q96DB5 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RMDN1Q96DB5 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RMDN1Q96DB5 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RMDN1Q96DB5 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RMDN1Q96DB5 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
RMDN1Q96DB5 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RMDN1Q96DB5 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RMDN1Q96DB5 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RMDN1Q96DB5 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RMDN1Q96DB5 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RMDN1Q96DB5 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RMDN1Q96DB5 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
RMDN1Q96DB5 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RMDN1Q96DB5 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
RMDN1Q96DB5 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RMDN1Q96DB5 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RMDN1Q96DB5 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
RMDN1Q96DB5 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RMDN1Q96DB5 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RMDN1Q96DB5 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RMDN1Q96DB5 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RMDN1Q96DB5 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RMDN1Q96DB5 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RMDN1Q96DB5 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RMDN1Q96DB5 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RMDN1Q96DB5 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RMDN1Q96DB5 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RMDN1Q96DB5 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RMDN1Q96DB5 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RMDN1Q96DB5 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
RMDN1Q96DB5 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RMDN1Q96DB5 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RMDN1Q96DB5 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RMDN1Q96DB5 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RMDN1Q96DB5 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RMDN1Q96DB5 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RMDN1Q96DB5 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RMDN1Q96DB5 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RMDN1Q96DB5 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RMDN1Q96DB5 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
RMDN1Q96DB5 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RMDN1Q96DB5 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RMDN1Q96DB5 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RMDN1Q96DB5 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.1 ms