Protein–RNA interactions for Protein: Q96BQ1

FAM3D, Protein FAM3D, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3DQ96BQ1 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
FAM3DQ96BQ1 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
FAM3DQ96BQ1 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
FAM3DQ96BQ1 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
FAM3DQ96BQ1 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
FAM3DQ96BQ1 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
FAM3DQ96BQ1 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
FAM3DQ96BQ1 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
FAM3DQ96BQ1 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
FAM3DQ96BQ1 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
FAM3DQ96BQ1 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
FAM3DQ96BQ1 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
FAM3DQ96BQ1 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
FAM3DQ96BQ1 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
FAM3DQ96BQ1 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
FAM3DQ96BQ1 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
FAM3DQ96BQ1 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
FAM3DQ96BQ1 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
FAM3DQ96BQ1 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
FAM3DQ96BQ1 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
FAM3DQ96BQ1 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
FAM3DQ96BQ1 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
FAM3DQ96BQ1 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
FAM3DQ96BQ1 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
FAM3DQ96BQ1 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
FAM3DQ96BQ1 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
FAM3DQ96BQ1 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
FAM3DQ96BQ1 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
FAM3DQ96BQ1 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
FAM3DQ96BQ1 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
FAM3DQ96BQ1 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
FAM3DQ96BQ1 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
FAM3DQ96BQ1 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
FAM3DQ96BQ1 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
FAM3DQ96BQ1 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
FAM3DQ96BQ1 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
FAM3DQ96BQ1 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FAM3DQ96BQ1 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
FAM3DQ96BQ1 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
FAM3DQ96BQ1 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FAM3DQ96BQ1 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
FAM3DQ96BQ1 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FAM3DQ96BQ1 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FAM3DQ96BQ1 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FAM3DQ96BQ1 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
FAM3DQ96BQ1 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FAM3DQ96BQ1 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FAM3DQ96BQ1 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
FAM3DQ96BQ1 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FAM3DQ96BQ1 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FAM3DQ96BQ1 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FAM3DQ96BQ1 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
FAM3DQ96BQ1 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
FAM3DQ96BQ1 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
FAM3DQ96BQ1 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
FAM3DQ96BQ1 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
FAM3DQ96BQ1 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
FAM3DQ96BQ1 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
FAM3DQ96BQ1 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
FAM3DQ96BQ1 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
FAM3DQ96BQ1 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
FAM3DQ96BQ1 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
FAM3DQ96BQ1 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
FAM3DQ96BQ1 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
FAM3DQ96BQ1 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
FAM3DQ96BQ1 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
FAM3DQ96BQ1 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
FAM3DQ96BQ1 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
FAM3DQ96BQ1 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
FAM3DQ96BQ1 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
FAM3DQ96BQ1 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
FAM3DQ96BQ1 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
FAM3DQ96BQ1 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
FAM3DQ96BQ1 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
FAM3DQ96BQ1 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
FAM3DQ96BQ1 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
FAM3DQ96BQ1 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
FAM3DQ96BQ1 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
FAM3DQ96BQ1 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
FAM3DQ96BQ1 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
FAM3DQ96BQ1 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
FAM3DQ96BQ1 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC18.34■□□□□ 0.53
FAM3DQ96BQ1 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
FAM3DQ96BQ1 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
FAM3DQ96BQ1 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
FAM3DQ96BQ1 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
FAM3DQ96BQ1 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
FAM3DQ96BQ1 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
FAM3DQ96BQ1 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
FAM3DQ96BQ1 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
FAM3DQ96BQ1 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
FAM3DQ96BQ1 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
FAM3DQ96BQ1 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
FAM3DQ96BQ1 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
FAM3DQ96BQ1 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
FAM3DQ96BQ1 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
FAM3DQ96BQ1 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
FAM3DQ96BQ1 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
FAM3DQ96BQ1 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
FAM3DQ96BQ1 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
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