Protein–RNA interactions for Protein: Q96B54

ZNF428, Zinc finger protein 428, humanhuman

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF428Q96B54 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
ZNF428Q96B54 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ZNF428Q96B54 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
ZNF428Q96B54 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
ZNF428Q96B54 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
ZNF428Q96B54 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ZNF428Q96B54 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ZNF428Q96B54 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC27.54■■■□□ 2
ZNF428Q96B54 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
ZNF428Q96B54 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ZNF428Q96B54 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ZNF428Q96B54 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ZNF428Q96B54 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
ZNF428Q96B54 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ZNF428Q96B54 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC27.53■■■□□ 2
ZNF428Q96B54 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ZNF428Q96B54 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ZNF428Q96B54 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC27.53■■■□□ 2
ZNF428Q96B54 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
ZNF428Q96B54 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
ZNF428Q96B54 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ZNF428Q96B54 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
ZNF428Q96B54 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
ZNF428Q96B54 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ZNF428Q96B54 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
ZNF428Q96B54 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ZNF428Q96B54 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
ZNF428Q96B54 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ZNF428Q96B54 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ZNF428Q96B54 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ZNF428Q96B54 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
ZNF428Q96B54 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ZNF428Q96B54 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ZNF428Q96B54 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
ZNF428Q96B54 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ZNF428Q96B54 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
ZNF428Q96B54 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ZNF428Q96B54 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ZNF428Q96B54 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
ZNF428Q96B54 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
ZNF428Q96B54 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■■□□ 2
ZNF428Q96B54 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
ZNF428Q96B54 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
ZNF428Q96B54 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
ZNF428Q96B54 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
ZNF428Q96B54 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
ZNF428Q96B54 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
ZNF428Q96B54 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
ZNF428Q96B54 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC27.51■■□□□ 1.99
ZNF428Q96B54 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
ZNF428Q96B54 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
ZNF428Q96B54 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
ZNF428Q96B54 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
ZNF428Q96B54 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
ZNF428Q96B54 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
ZNF428Q96B54 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
ZNF428Q96B54 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
ZNF428Q96B54 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
ZNF428Q96B54 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ZNF428Q96B54 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
ZNF428Q96B54 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ZNF428Q96B54 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
ZNF428Q96B54 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ZNF428Q96B54 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ZNF428Q96B54 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
ZNF428Q96B54 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ZNF428Q96B54 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ZNF428Q96B54 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ZNF428Q96B54 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
ZNF428Q96B54 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
ZNF428Q96B54 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
ZNF428Q96B54 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
ZNF428Q96B54 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
ZNF428Q96B54 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
ZNF428Q96B54 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
ZNF428Q96B54 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ZNF428Q96B54 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
ZNF428Q96B54 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
ZNF428Q96B54 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
ZNF428Q96B54 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ZNF428Q96B54 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ZNF428Q96B54 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
ZNF428Q96B54 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
ZNF428Q96B54 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC27.48■■□□□ 1.99
ZNF428Q96B54 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
ZNF428Q96B54 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
ZNF428Q96B54 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
ZNF428Q96B54 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ZNF428Q96B54 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
ZNF428Q96B54 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ZNF428Q96B54 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ZNF428Q96B54 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ZNF428Q96B54 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
ZNF428Q96B54 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ZNF428Q96B54 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC27.47■■□□□ 1.99
ZNF428Q96B54 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
ZNF428Q96B54 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
ZNF428Q96B54 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
ZNF428Q96B54 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ZNF428Q96B54 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms