Protein–RNA interactions for Protein: Q96AJ1

CLUAP1, Clusterin-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 413 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLUAP1Q96AJ1 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CLUAP1Q96AJ1 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CLUAP1Q96AJ1 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CLUAP1Q96AJ1 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CLUAP1Q96AJ1 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CLUAP1Q96AJ1 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CLUAP1Q96AJ1 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CLUAP1Q96AJ1 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CLUAP1Q96AJ1 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CLUAP1Q96AJ1 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CLUAP1Q96AJ1 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CLUAP1Q96AJ1 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CLUAP1Q96AJ1 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CLUAP1Q96AJ1 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CLUAP1Q96AJ1 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CLUAP1Q96AJ1 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CLUAP1Q96AJ1 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CLUAP1Q96AJ1 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CLUAP1Q96AJ1 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CLUAP1Q96AJ1 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CLUAP1Q96AJ1 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
CLUAP1Q96AJ1 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CLUAP1Q96AJ1 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
CLUAP1Q96AJ1 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CLUAP1Q96AJ1 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CLUAP1Q96AJ1 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CLUAP1Q96AJ1 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CLUAP1Q96AJ1 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CLUAP1Q96AJ1 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CLUAP1Q96AJ1 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CLUAP1Q96AJ1 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CLUAP1Q96AJ1 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CLUAP1Q96AJ1 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CLUAP1Q96AJ1 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CLUAP1Q96AJ1 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CLUAP1Q96AJ1 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CLUAP1Q96AJ1 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CLUAP1Q96AJ1 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CLUAP1Q96AJ1 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CLUAP1Q96AJ1 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CLUAP1Q96AJ1 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CLUAP1Q96AJ1 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CLUAP1Q96AJ1 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CLUAP1Q96AJ1 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CLUAP1Q96AJ1 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CLUAP1Q96AJ1 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CLUAP1Q96AJ1 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CLUAP1Q96AJ1 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CLUAP1Q96AJ1 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CLUAP1Q96AJ1 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CLUAP1Q96AJ1 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CLUAP1Q96AJ1 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CLUAP1Q96AJ1 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CLUAP1Q96AJ1 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CLUAP1Q96AJ1 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CLUAP1Q96AJ1 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CLUAP1Q96AJ1 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CLUAP1Q96AJ1 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CLUAP1Q96AJ1 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CLUAP1Q96AJ1 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CLUAP1Q96AJ1 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CLUAP1Q96AJ1 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CLUAP1Q96AJ1 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CLUAP1Q96AJ1 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CLUAP1Q96AJ1 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CLUAP1Q96AJ1 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CLUAP1Q96AJ1 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CLUAP1Q96AJ1 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CLUAP1Q96AJ1 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CLUAP1Q96AJ1 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CLUAP1Q96AJ1 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CLUAP1Q96AJ1 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CLUAP1Q96AJ1 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CLUAP1Q96AJ1 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CLUAP1Q96AJ1 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CLUAP1Q96AJ1 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CLUAP1Q96AJ1 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CLUAP1Q96AJ1 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CLUAP1Q96AJ1 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CLUAP1Q96AJ1 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
CLUAP1Q96AJ1 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CLUAP1Q96AJ1 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CLUAP1Q96AJ1 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CLUAP1Q96AJ1 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CLUAP1Q96AJ1 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CLUAP1Q96AJ1 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CLUAP1Q96AJ1 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CLUAP1Q96AJ1 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CLUAP1Q96AJ1 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CLUAP1Q96AJ1 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CLUAP1Q96AJ1 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CLUAP1Q96AJ1 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CLUAP1Q96AJ1 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CLUAP1Q96AJ1 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CLUAP1Q96AJ1 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CLUAP1Q96AJ1 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CLUAP1Q96AJ1 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CLUAP1Q96AJ1 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
CLUAP1Q96AJ1 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CLUAP1Q96AJ1 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms