Protein–RNA interactions for Protein: Q96AE7

TTC17, Tetratricopeptide repeat protein 17, humanhuman

Predictions only

Length 1,141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC17Q96AE7 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TTC17Q96AE7 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TTC17Q96AE7 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TTC17Q96AE7 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TTC17Q96AE7 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TTC17Q96AE7 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TTC17Q96AE7 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TTC17Q96AE7 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TTC17Q96AE7 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TTC17Q96AE7 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
TTC17Q96AE7 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TTC17Q96AE7 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
TTC17Q96AE7 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TTC17Q96AE7 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TTC17Q96AE7 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TTC17Q96AE7 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TTC17Q96AE7 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TTC17Q96AE7 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TTC17Q96AE7 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TTC17Q96AE7 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TTC17Q96AE7 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TTC17Q96AE7 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TTC17Q96AE7 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TTC17Q96AE7 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TTC17Q96AE7 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TTC17Q96AE7 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TTC17Q96AE7 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TTC17Q96AE7 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TTC17Q96AE7 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TTC17Q96AE7 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TTC17Q96AE7 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TTC17Q96AE7 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TTC17Q96AE7 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TTC17Q96AE7 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TTC17Q96AE7 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TTC17Q96AE7 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TTC17Q96AE7 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
TTC17Q96AE7 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TTC17Q96AE7 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TTC17Q96AE7 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TTC17Q96AE7 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TTC17Q96AE7 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TTC17Q96AE7 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TTC17Q96AE7 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TTC17Q96AE7 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TTC17Q96AE7 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TTC17Q96AE7 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TTC17Q96AE7 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TTC17Q96AE7 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TTC17Q96AE7 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
TTC17Q96AE7 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TTC17Q96AE7 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
TTC17Q96AE7 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
TTC17Q96AE7 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TTC17Q96AE7 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TTC17Q96AE7 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TTC17Q96AE7 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TTC17Q96AE7 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TTC17Q96AE7 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TTC17Q96AE7 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TTC17Q96AE7 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TTC17Q96AE7 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TTC17Q96AE7 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TTC17Q96AE7 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TTC17Q96AE7 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TTC17Q96AE7 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TTC17Q96AE7 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TTC17Q96AE7 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TTC17Q96AE7 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TTC17Q96AE7 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TTC17Q96AE7 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TTC17Q96AE7 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TTC17Q96AE7 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TTC17Q96AE7 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TTC17Q96AE7 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TTC17Q96AE7 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TTC17Q96AE7 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TTC17Q96AE7 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TTC17Q96AE7 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TTC17Q96AE7 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TTC17Q96AE7 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TTC17Q96AE7 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TTC17Q96AE7 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TTC17Q96AE7 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TTC17Q96AE7 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TTC17Q96AE7 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TTC17Q96AE7 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TTC17Q96AE7 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TTC17Q96AE7 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TTC17Q96AE7 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TTC17Q96AE7 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TTC17Q96AE7 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TTC17Q96AE7 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TTC17Q96AE7 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TTC17Q96AE7 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TTC17Q96AE7 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TTC17Q96AE7 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TTC17Q96AE7 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TTC17Q96AE7 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
TTC17Q96AE7 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms