Protein–RNA interactions for Protein: Q969G6

RFK, Riboflavin kinase, humanhuman

Predictions only

Length 155 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFKQ969G6 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
RFKQ969G6 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
RFKQ969G6 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
RFKQ969G6 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
RFKQ969G6 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RFKQ969G6 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RFKQ969G6 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
RFKQ969G6 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
RFKQ969G6 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
RFKQ969G6 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
RFKQ969G6 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RFKQ969G6 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RFKQ969G6 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RFKQ969G6 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RFKQ969G6 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RFKQ969G6 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
RFKQ969G6 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
RFKQ969G6 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RFKQ969G6 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
RFKQ969G6 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
RFKQ969G6 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RFKQ969G6 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RFKQ969G6 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
RFKQ969G6 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RFKQ969G6 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RFKQ969G6 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RFKQ969G6 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RFKQ969G6 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RFKQ969G6 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RFKQ969G6 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RFKQ969G6 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RFKQ969G6 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RFKQ969G6 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RFKQ969G6 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RFKQ969G6 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RFKQ969G6 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
RFKQ969G6 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RFKQ969G6 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RFKQ969G6 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RFKQ969G6 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RFKQ969G6 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RFKQ969G6 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RFKQ969G6 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RFKQ969G6 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RFKQ969G6 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
RFKQ969G6 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
RFKQ969G6 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RFKQ969G6 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RFKQ969G6 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RFKQ969G6 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RFKQ969G6 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RFKQ969G6 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RFKQ969G6 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RFKQ969G6 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RFKQ969G6 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RFKQ969G6 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RFKQ969G6 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RFKQ969G6 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RFKQ969G6 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RFKQ969G6 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RFKQ969G6 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RFKQ969G6 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RFKQ969G6 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
RFKQ969G6 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RFKQ969G6 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RFKQ969G6 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RFKQ969G6 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RFKQ969G6 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RFKQ969G6 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RFKQ969G6 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RFKQ969G6 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RFKQ969G6 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RFKQ969G6 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RFKQ969G6 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RFKQ969G6 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RFKQ969G6 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RFKQ969G6 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RFKQ969G6 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RFKQ969G6 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
RFKQ969G6 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RFKQ969G6 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RFKQ969G6 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RFKQ969G6 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RFKQ969G6 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RFKQ969G6 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RFKQ969G6 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RFKQ969G6 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RFKQ969G6 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RFKQ969G6 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
RFKQ969G6 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RFKQ969G6 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RFKQ969G6 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RFKQ969G6 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RFKQ969G6 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RFKQ969G6 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RFKQ969G6 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RFKQ969G6 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RFKQ969G6 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RFKQ969G6 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RFKQ969G6 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms