Protein–RNA interactions for Protein: Q92878

RAD50, DNA repair protein RAD50, humanhuman

Predictions only

Length 1,312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD50Q92878 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RAD50Q92878 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RAD50Q92878 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RAD50Q92878 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RAD50Q92878 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RAD50Q92878 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RAD50Q92878 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RAD50Q92878 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RAD50Q92878 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RAD50Q92878 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RAD50Q92878 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RAD50Q92878 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RAD50Q92878 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RAD50Q92878 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RAD50Q92878 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RAD50Q92878 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
RAD50Q92878 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RAD50Q92878 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RAD50Q92878 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RAD50Q92878 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RAD50Q92878 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RAD50Q92878 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RAD50Q92878 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RAD50Q92878 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
RAD50Q92878 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC25.7■■□□□ 1.71
RAD50Q92878 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
RAD50Q92878 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
RAD50Q92878 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
RAD50Q92878 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
RAD50Q92878 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
RAD50Q92878 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC25.7■■□□□ 1.71
RAD50Q92878 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
RAD50Q92878 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
RAD50Q92878 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
RAD50Q92878 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
RAD50Q92878 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RAD50Q92878 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
RAD50Q92878 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RAD50Q92878 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
RAD50Q92878 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
RAD50Q92878 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RAD50Q92878 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RAD50Q92878 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RAD50Q92878 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
RAD50Q92878 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
RAD50Q92878 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
RAD50Q92878 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
RAD50Q92878 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RAD50Q92878 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
RAD50Q92878 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
RAD50Q92878 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RAD50Q92878 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
RAD50Q92878 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
RAD50Q92878 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
RAD50Q92878 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
RAD50Q92878 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
RAD50Q92878 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RAD50Q92878 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RAD50Q92878 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
RAD50Q92878 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
RAD50Q92878 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
RAD50Q92878 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
RAD50Q92878 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
RAD50Q92878 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RAD50Q92878 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
RAD50Q92878 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
RAD50Q92878 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
RAD50Q92878 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RAD50Q92878 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RAD50Q92878 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
RAD50Q92878 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RAD50Q92878 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
RAD50Q92878 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
RAD50Q92878 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
RAD50Q92878 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
RAD50Q92878 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RAD50Q92878 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RAD50Q92878 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RAD50Q92878 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
RAD50Q92878 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RAD50Q92878 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RAD50Q92878 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
RAD50Q92878 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
RAD50Q92878 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
RAD50Q92878 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
RAD50Q92878 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
RAD50Q92878 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
RAD50Q92878 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RAD50Q92878 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RAD50Q92878 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
RAD50Q92878 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RAD50Q92878 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
RAD50Q92878 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
RAD50Q92878 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
RAD50Q92878 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
RAD50Q92878 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
RAD50Q92878 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
RAD50Q92878 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
RAD50Q92878 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
RAD50Q92878 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms